根據(jù)死者身上殘留的余溫，新一和服部推斷出兇手就在這附近，他們借用偶然碰見(jiàn)的高木警官的權(quán)力封鎖了收費(fèi)站，并且很快將犯人鎖定在三個(gè)人身上，之后，他們又在死者的車窗上發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)小孔，這無(wú)疑是揪出兇手的關(guān)鍵性線索，然而，灰原給新一的藥即將失效，新一該如何應(yīng)對(duì)？小蘭一直吞吞吐吐想要告訴他的話又是什么？

沒(méi)過(guò)多久本堂瑛佑再次找到小五郎說(shuō)他在網(wǎng)上發(fā)現(xiàn)了一件有趣的事情，于是就把他們帶到了鳥(niǎo)矢町，沒(méi)想到竟然在這里遇見(jiàn)了高木和目暮警官，他們正在調(diào)查一起兇殺案，死者是住在附近的船本太太，就在大家詢問(wèn)案情的期間，船本家的兒子透司說(shuō)兇手是一個(gè)穿著黑衣服的外國(guó)女人，難道是黑衣組織？這時(shí)，柯南突然想起這個(gè)小男孩就是曾出現(xiàn)在水無(wú)憐奈車禍現(xiàn)場(chǎng)的人。

柯南在和大家一起吃壽司的時(shí)候?qū)⑿∥謇陕樽恚?dāng)面戳穿了前來(lái)領(lǐng)獎(jiǎng)的兩名冒牌貨，幫胡桃找到了記憶中的少年。雖然這件事情成功解決，但是十五年前的連續(xù)殺人案卻依舊找不到眉目，案件將在三天后失效，可目前追查兇手的線索卻只有有兩條。在柯南一行人去步美家玩的時(shí)候，灰原說(shuō)自己在這棟公寓里遇見(jiàn)了一個(gè)穿著大衣吹著口哨的男人，難道十五年前的殺人兇手出現(xiàn)了？

警方將這三人都帶到了地下停車場(chǎng)，他們分別是兒島、稻垣和玄田，根據(jù)受害者指著元太說(shuō)“L”的信息，步美和光彥就認(rèn)為歹徒是與元太名字相近的家伙，便分別對(duì)他們提出質(zhì)疑，但都被柯南否定。與此同時(shí)，柯南也已經(jīng)知道了歹徒的身份，他躲在阿笠博士身后，用變聲領(lǐng)結(jié)說(shuō)出了真相！

一名老護(hù)士告訴柯南，她以前見(jiàn)過(guò)英祐并且在他小的時(shí)候還因白血病做過(guò)手術(shù)。另一方面，得知杯戶中央醫(yī)院被黑暗組織入侵后，柯南和FBI立刻對(duì)醫(yī)院的病人進(jìn)行了排查，其中最具嫌疑的有三個(gè)人，為找出那個(gè)在醫(yī)院調(diào)查水無(wú)憐奈的人，柯南想出了一條妙計(jì)，他直接與這三個(gè)嫌疑者接觸，最終將目標(biāo)鎖定，在接下來(lái)的行動(dòng)中，柯南和FBI又能得到什么樣的線索？