唐三為小舞梳頭，不由地聊起了各自的家庭，兩個人越聊越投機，小舞高高興興去吃飯，王圣等人趕忙湊過來好奇地問東問西，唐三心里坦蕩蕩，他夸小舞是一個很單純的姑娘。蕭塵宇派柳龍在女生寢室找了一大圈，也不見小舞的人影，沒想到小舞竟然住在七舍，而且還是這里的老大，蕭塵宇大為惱火。小舞興沖沖拉著唐三去食堂吃飯，蕭塵宇邀請小舞去魂師會館吃好吃的，小舞根本不領情，柳龍沖小舞大呼小叫，要強行拉她走，小舞飛起一腳把柳龍打翻在地，蕭塵宇惱羞成怒，還搬出苑長是他三叔來說事，唐三根本不買賬，拉起小舞就去食堂吃飯了。理論課考試的時候，柳龍不會答題，就搶了王圣的卷子，還倒打一耙，誣陷王圣作弊，唐三和小舞站出來揭穿柳龍，監考老師不容分說把柳龍和王圣趕出去。接下來就是武魂格斗課，教官讓蕭塵宇給同學們做示范，蕭塵宇讓唐三做他的搭檔，其實就是想讓唐三當活靶子，趁此機會好好教訓唐三，蕭塵宇揮拳擊打唐三胸口，他被打得站立不穩差點摔倒，蕭塵宇步步緊逼，招招致命，一一被唐三巧妙化解，兩個學員分別死死拉住唐三的手臂，蕭塵宇揮拳狠狠打向他的腹部，唐三紋絲不動，蕭塵宇感覺有一股巨大的反擊力量，十分驚訝唐三如何反擊的。教官讓學員們擊打沙袋練

柯南等人幫助舊書店店主裕次郎搬運書籍，并在書店遇到了裕次郎的兒子一郎。一郎對于父親經營舊書店的事感到很不滿，爭執中眾人不歡而散。在光彥的帶領下，柯南等人來到了舊書店旁的公園，準備觀看蒸汽機車發動的場面，并在等待的途中偶遇了一郎。正當眾人與蒸汽機車合影完畢返回書店時，卻發現裕次郎被壓在了倒塌的書架下面……

鷹取嚴男在取回寶石后將柯南扔在了馬路中間的綠化帶中，柯南受不住沖擊昏了過去，當他醒來時鷹取早已不見蹤影。柯南隨后被送到醫院檢查，所幸身體沒有受傷。柯南想弄清案件的真相，趁病房沒人偷溜出去尋找線索。他先去尋找之前在鷹取身上發現的酒吧地址，在酒吧隔壁的房間里竟然發現了被盜珠寶店的采購員的尸體。

柯南在靈車中發現了遺失的遺囑，小蘭和少年偵探團趕到會場后才發現葬禮已經結束，而靈車正開往火葬場。情況十萬火急，小蘭等人在尸體火化前趕到了火葬場，而棺材內卻并沒有找到柯南，在大家束手無策時又傳來了柯南的訊息。靈車有兩輛，而載著柯南的老舊靈車正駛向報廢場，在不知道靈車內有人的情況下柯南的處境十分危險。

利用步美找到的暗號解讀表，柯南本以為能順利解開暗號，不料卻遇到了瓶頸。正當此時，若狹老師再次拜托少年偵探團前往舊倉庫尋找石灰。來到舊倉庫的眾人發現倉庫一片狼藉，在若狹老師不經意的提示下，柯南終于解開了暗號的含義，并推測犯人將再次來到舊倉庫。為了避免打草驚蛇，柯南設計誤導犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來到舊倉庫，柯南能否順利將犯人一網打盡？