高木剛說(shuō)完十八年的搶匪就在佐藤正義警官的四位老友之中后，便突然失去了音訊，按照柯南的建議，佐藤警官急忙趕到他們四人所去的酒屋，卻發(fā)現(xiàn)他們?cè)缫央x開(kāi)，根據(jù)老板的供詞柯南推理出了誰(shuí)是當(dāng)年的歹徒，他告訴佐藤后，讓她自己去了結(jié)這宗案件。另一邊，步美等人私自跟蹤縱火犯遇到危險(xiǎn)，幸虧柯南及時(shí)趕到才得以獲救，而這名縱火犯也被警方逮捕。

霧之峰賓館的主人寺院晚上開(kāi)車出去兜風(fēng)，第二天在停車場(chǎng)發(fā)現(xiàn)坐在車子里的寺院已經(jīng)死了。在調(diào)查的過(guò)程中發(fā)現(xiàn)每個(gè)人和寺院似乎都有過(guò)節(jié)。柯南發(fā)現(xiàn)車罩上裂痕的疑點(diǎn)，而停車場(chǎng)看守的證詞又增加了疑團(tuán)。最終柯南發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法并當(dāng)場(chǎng)演示給眾人，而殘留的焦油也暴露了兇手的身份。

柯南等人循著灰原留下的記號(hào)一路尋找，因?yàn)閮词志驮谕械娜C人之中，灰原和光彥就在大樹(shù)下面留下一些散落的蘑菇作為暗號(hào)，躲在叢林里期望柯南能有所行動(dòng)制服兇手。柯南果然不負(fù)眾望，破解了灰原留下的暗號(hào)，正準(zhǔn)備麻醉兇手時(shí)，卻又有所猶豫，并大聲喊出了灰原和光彥，柯南到底有何用意？

柯南等也到同一個(gè)餐廳吃飯，聽(tīng)說(shuō)與這幾個(gè)漁夫相約的人在海邊溺死了。伊豆海邊發(fā)生了殺人事件。柯南已經(jīng)確認(rèn)了犯人的真實(shí)身份并利用因?yàn)榕莸胶Ｋ餆o(wú)法確定死亡時(shí)間這個(gè)baga套出了犯人的話，面對(duì)現(xiàn)實(shí)，犯人最終承認(rèn)了自己的罪行。因?yàn)闅⑺懒俗约旱母赣H而懷恨在心，最終痛下殺手。但自己的這番行為卻得不到同伴的贊同發(fā)怒的兇手最終在小蘭的話語(yǔ)中認(rèn)識(shí)到自己的錯(cuò)誤。

死者是奈緒子，柯南和服部在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)發(fā)現(xiàn)了魚(yú)鱗和腳印，然而腳印的方向卻通向大海，只靠這些零星的線索，根本無(wú)法抓到兇手。這時(shí)，君惠說(shuō)她有今年祭典購(gòu)買號(hào)碼牌的名冊(cè)，于是柯南一行人前往神社，悲劇再次發(fā)生，君惠為找名冊(cè)死在倉(cāng)庫(kù)的大火之中。之后，柯南和服部分頭行動(dòng)，服部發(fā)現(xiàn)了新的線索，正巧此時(shí)柯南打來(lái)電話，他到底推理出了怎樣的真相而讓服部吃驚不已？上山找門(mén)脅時(shí)，和葉為救服部墜落懸崖，她能否化險(xiǎn)為夷？