為防止基德混入人群，次郎吉將所有人都隔離在防護(hù)網(wǎng)外，在眾粉絲表示不滿的同時(shí)，基德也宣告自己不會(huì)在如此冷清的舞臺(tái)表演，在他的煽動(dòng)下，粉絲們沖破包圍網(wǎng)。魔術(shù)表演開始以前，他找到死對(duì)頭柯南并在他身上安裝了竊聽器，一切準(zhǔn)備就緒，基德順利拿走了寶石鞋子，然而就在他通往樓頂?shù)耐局校雌扑查g移動(dòng)的柯南出現(xiàn)在樓頂……

小林老師在圖書館里發(fā)現(xiàn)了一個(gè)牛皮錢包，那里放了小學(xué)一年級(jí)時(shí)小蘭留的字條。事情追溯到十年前，為證實(shí)謠言的真假，小蘭和新一夜訪校園，不想?yún)s在學(xué)校圖書館遇到了一個(gè)自稱是新一弟弟的神秘男子，他向新一發(fā)出挑戰(zhàn)并在留下了一個(gè)裝有暗號(hào)的牛皮錢包后離開。于是，新一和小蘭二人就在阿笠博士的幫助下展開了解謎暗號(hào)的尋寶之旅！

柯南、小蘭和園子一起去醫(yī)院看望國(guó)中同學(xué)的時(shí)候，遇到了拿著照片四處詢問(wèn)的本堂英祐，照片上的人正是水無(wú)憐奈，但英祐卻堅(jiān)持認(rèn)為水無(wú)憐奈和姐姐是兩個(gè)人，于是，小蘭打電話給水無(wú)憐奈的超級(jí)粉絲庵野進(jìn)行確認(rèn)，沒(méi)想到對(duì)方竟然說(shuō)她打錯(cuò)了，隨后一行人來(lái)到庵野家，他的母親正準(zhǔn)備出門取錢，柯南察覺(jué)到事有蹊蹺，斷定讓她打錢的那個(gè)人根本就是詐欺犯，在大家的幫助下，詐欺犯被送往了警局，而尋找水無(wú)憐奈也進(jìn)入了正題。

本堂瑛佑再次造訪毛利事務(wù)所，就在大家聚在一起討論許久未露面的歌手板垣時(shí)，來(lái)了一對(duì)父子，孩子說(shuō)他曾在一座大橋上目擊到頭發(fā)像鋸子一般的板垣的尸體，還看到處理尸體的人身上有釘子紋身并且在他們的周圍還有錘子形狀的物體，小五郎認(rèn)為這不過(guò)是小孩子撒謊的把戲，然而本堂通過(guò)摸他脖子上的脈搏判斷真假，這一幕讓柯南想起的水無(wú)，不禁開始懷疑本堂。之后，為了找尋更多線索，大家決定尋找這個(gè)小目擊者所說(shuō)的大橋。

沒(méi)過(guò)多久，綁匪就打來(lái)電話威脅柯南他們盡快找到寶藏，不然難保灰原他們安全。人命關(guān)天，柯南絞盡腦汁想要破解暗號(hào)，他發(fā)現(xiàn)萩市地圖與貓圖相吻合，而貓眼的地方就是線索的所在，于是，他們來(lái)到了円政寺，并在這里找到了日記中被撕掉的一頁(yè)，柯南將這些零散的圖片拼接成一條路線，大伙兒照此地圖找到了一個(gè)地下山洞，就在寶物將要到手之時(shí)，黑衣人綁匪出現(xiàn)……