千葉警官在警局四處詢(xún)問(wèn)有關(guān)“不明飛行物”的線(xiàn)索，卻毫無(wú)所獲，這天他回到家，收到了聲稱(chēng)是自己宇宙第一大粉絲的人寄來(lái)的神秘郵件。在另一邊，名為和田陽(yáng)奈的女高中生來(lái)到毛利事務(wù)所，委托小五郎調(diào)查杯戶(hù)公園“UFO”一事。杯戶(hù)公園隔壁的杯戶(hù)高中發(fā)生殺人案件，這兩者是否有聯(lián)系？

毛利小五郎帶柯南和小蘭來(lái)高級(jí)餐廳用餐，進(jìn)門(mén)后三人發(fā)現(xiàn)桌上擺滿(mǎn)了食物卻沒(méi)有客人，并在廚房發(fā)現(xiàn)了倒在地上的廚師口石先生。清醒后的口石先生告訴三人，原本有五名客人在餐廳里用餐，不料自己在做飯時(shí)遭到了歹徒的襲擊，客人們也不知去向。毛利小五郎馬上通知了目暮警官，并查清了每個(gè)客人的身份，然而卻難以判斷消失的客人們?nèi)チ撕翁帯Ｕ谶@時(shí)，擺放在餐桌上的甜點(diǎn)和雜物引起了柯南的注意。

"圣魂村地處偏僻，山路崎嶇，村里人煙稀少，很少與外界接觸。在竹林深處的小木屋里，爐膛里的小火苗燒得正旺，盡管外面下著鵝毛大雪，可是小木屋里卻溫暖如春，少年唐三睡得正酣，他又一次夢(mèng)到自己來(lái)到一個(gè)魔幻世界，地上種滿(mǎn)了藍(lán)銀草，遠(yuǎn)處傳來(lái)一個(gè)女人溫柔的喊聲，她喊著唐三的名字，答應(yīng)會(huì)一直等他，唐三被夢(mèng)嚇醒，他覺(jué)得那溫柔的聲音是母親的。唐三冒著大雪出去劈柴，把爐膛的火加到更旺，他準(zhǔn)備好飯菜給父親唐昊送來(lái)，發(fā)現(xiàn)他又醉得不省人事，自從妻子三妹難產(chǎn)死后，唐昊就因傷心過(guò)度開(kāi)始酗酒，唐三很小就看到父親這樣，他早已經(jīng)司空見(jiàn)慣，把父親扶到床上睡下。天剛蒙蒙亮，唐三就像平常一樣拿著那本“玄天寶錄”來(lái)到森林深處修煉絕技，這門(mén)絕技必須在清晨紫氣東來(lái)的時(shí)候修煉，唐三一心想練到玄天功第九重，可是過(guò)了第一重就遇到了瓶頸，他始終無(wú)法沖破。唐三聚精會(huì)神練功后，返程路上看到倒地的車(chē)子，聽(tīng)到旁邊傳來(lái)奇怪的聲響，唐三扒開(kāi)草叢，發(fā)現(xiàn)人面魔蛛只得慌忙逃跑，逃跑途中擺脫不了只能用他的暗器刺瞎人面魔蛛的眼睛。可這刺激人面魔蛛來(lái)尋仇，唐三拼命反抗，人面魔蛛對(duì)他步步緊逼，招招致命，唐三嚇得落荒而逃，魔蛛對(duì)他窮追不舍，唐三腳下一滑摔倒在地，他嚇得緊

受宿里村村長(zhǎng)之邀，柯南和平次等人共同前往宿里村尋寶。到達(dá)旅店后，通過(guò)與其他幾位考古學(xué)家和歷史學(xué)家交談，他們得知在寶藏的埋藏之處曾發(fā)生過(guò)塌方事故，其中一位外國(guó)挖掘隊(duì)員在彌留之際寫(xiě)下了意為“鵺”的字條，而鵺正是傳說(shuō)中極為兇猛的怪獸。飯后當(dāng)眾人準(zhǔn)備回房休息，平次卻突然發(fā)現(xiàn)門(mén)前失火，眾人在火中看到了體型巨大的怪獸。為了一探究竟的柯南和平次在追蹤怪獸的過(guò)程中，卻發(fā)現(xiàn)了倒在血泊中已經(jīng)喪命的歷史學(xué)家。

死者被殺時(shí)手里握著剪刀，尸體的傷口處還粘滿(mǎn)了蜂蜜，不僅如此，案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的水龍頭還一直開(kāi)著，柯南和昴確定兇手就是零食店的仙波先生，但他們還一時(shí)半會(huì)兒找不到兇器。在詢(xún)問(wèn)了保鏢后柯南有了一些線(xiàn)索，阿笠博士在院子里看到的成群螞蟻也為他們提供了幫助，兇手到底是運(yùn)用了什么手法來(lái)作案的呢？