為了在春天享受滑雪之樂，阿笠博士帶著少年偵探隊搭公車前去滑雪，沒想到在新出老師和茱蒂老師上公車之后，灰原居然開始全身發抖，就在這個時候，穿著一身滑雪裝的兩個男人將公車劫持，柯南以座位為掩護，本打算偷偷利用行動電話通知警方，然而卻被歹徒識破并拿走了電話，歹徒是怎么準確的洞察到柯南的行動？坐在最后的三名乘客到底誰是歹徒的同伙？他們又是通過什么來傳遞信號?

柯南在從大阪回來的新干線中遇上了佐藤警官、高木警官。兩人正在押送毒品的秘密販賣者小倉。途中車內發現可疑的炸彈包裹。就在佐藤前去查看之時留下高木警官的時候，犯人小倉要求去廁所，卻在廁所中用刀刺自己的腹部身亡。而在調查的過程中佐藤發現小倉血跡的疑點，并推斷出這是他殺時間而非自殺。

少年偵探團在超市里玩從收銀條上的物品名稱猜晚飯的菜名的游戲。其中發現了可疑的收銀條，柯南她們開始尋找買這些東西的人，想要阻止他。通過分頭尋找自行車燈少年偵探團的成員們最終找到了犯人，但中途卻失去了犯人的行蹤。在元太無意的提醒下，柯南他們抓到犯人現行。最終柯南用腳力增強鞋制服了犯人。

青野木亮藏是在形成密室的茶室中被殺的，橫溝警官開始詢問時卻發現沒有人到過茶室,所有人都有不在場證明。在調查茶室外圍的時候柯南發現了兇手的犯罪手法和證據。“沉睡的小五郎”召集大家道出了兇手利用一根繩子的作案手法和犯人的身份。在鐵證下兇手終于承認自己的罪行并道出了原因。

小五郎等人乘坐BONNET公交車，來到一個叫“影秋村”的地方，中途上同車的村民奧村喝了自己帶的茶后死亡了。小五郎和柯南自動在“影秋村”展開搜查。村民們就是否交給警察調查與警方發生了沖突。原來村民就是否將卡扭車作為觀光車分成了兩派而奧村作為反對派的代表同村長為代表的贊成派一直有沖突。此時村長船木出現并提出委托費為100萬日元的委托。之后柯南得知村子里7年前的事故。夜晚在尾隨塔子的柯南卻聽到為了找他而進入神社的蘭的尖叫聲！？