這天，鐵頭、姜小牙和米小圈一起上學，當時三個人優哉游哉嘴里還啃著母親早上做的早餐，當時米小圈還抱著一個大熱狗，正吃得津津有味，忽然一輛大卡車直接沖著他們三個人過來，當時鐵頭和姜小牙嚇得哇哇大叫，米小圈離卡車最近，幾秒鐘的功夫，兩只眼睛一抹黑，直接栽倒在地上。等米小圈緩緩睜開眼睛，發現自己與死亡擦肩而過，卡車翻倒在他旁邊，恰好留下一個空隙，這個空隙中就有米小圈，真是萬幸中的萬幸啊，米小圈從驚懼中爬起身，不遠處，鐵頭抱著姜小牙也跌倒在地，姜小牙在地上坐起，發現自己在鐵頭的懷抱中毫發無損，頓時感激涕零，視鐵頭如再生父母，米小圈當場就語塞，平日里與鐵頭形影不離，關鍵時刻鐵頭卻選擇了保護姜小牙。當天，學校便因為鐵頭英勇救人的事情引起軒然大波，作為學校有名的通訊小記者何詩雨特意來到米小圈班級采訪調查，李黎艷羨地看著何詩雨，這個全校文明的小記者，不僅有傲嬌的外貌，并且頭腦及其靈活，每次寫出的采訪稿都能夠轟動全校，果真何詩雨采訪了米小圈班級同學，只撿對鐵頭有利的說，用生動形象的語言把鐵頭塑造成一個妥妥的小英雄。米小圈開始和鐵頭疏遠，鐵頭成了名人，卻一臉不開心，好像總是一副畏首畏尾的模樣，放學了，鐵頭拉

平次參加了全國高中生劍道大賽，他在個人賽中獲得了優異的成績，他決心打敗對手沖田然后向和葉告白。但是事情進展的并不順利，中場休息時場外發生了一起兇殺案。裁判拔谷士道在室外廁所旁被殺害，兇手穿著京都泉心高中的劍道護具，現場沒有目擊者，只有一位雙目失明的老人聽到了聲響。

小五郎帶蘭和柯南來到東京附近的度假山莊放松，在那里遇到了同樣來休閑的女大學生三人組。小五郎伴著美景喝了許多酒，正當他昏昏欲睡之時，河邊突然出現了異變。河水突然變紅，順水而下居然有一具尸體飄了過來，小五郎立刻清醒跳河救人，等打撈上來后大家驚覺這居然是剛才的女大學生之一的秋葉夕子。

柯南等人幫助舊書店店主裕次郎搬運書籍，并在書店遇到了裕次郎的兒子一郎。一郎對于父親經營舊書店的事感到很不滿，爭執中眾人不歡而散。在光彥的帶領下，柯南等人來到了舊書店旁的公園，準備觀看蒸汽機車發動的場面，并在等待的途中偶遇了一郎。正當眾人與蒸汽機車合影完畢返回書店時，卻發現裕次郎被壓在了倒塌的書架下面……

死者被殺時手里握著剪刀，尸體的傷口處還粘滿了蜂蜜，不僅如此，案發現場的水龍頭還一直開著，柯南和昴確定兇手就是零食店的仙波先生，但他們還一時半會兒找不到兇器。在詢問了保鏢后柯南有了一些線索，阿笠博士在院子里看到的成群螞蟻也為他們提供了幫助，兇手到底是運用了什么手法來作案的呢？