深夜大地震，帝丹神社的秦錢(qián)被落下的鐘壓下而死亡。次日早晨開(kāi)始調(diào)查，但是事情好象并不那么簡(jiǎn)單。柯南他們開(kāi)始在鎮(zhèn)子內(nèi)搜索。發(fā)現(xiàn)死者房間中頭部留出的血沾染的竹桿。可能是地震之后回房時(shí)遭遇不測(cè)。在高木警官即將放棄的時(shí)刻受到柯南假扮的暮目警官的鼓勵(lì)重新振作起來(lái)查案。經(jīng)過(guò)分下調(diào)查高木警官揭開(kāi)了事情的真相。

園子和小蘭差點(diǎn)被車撞了，由此認(rèn)識(shí)了那個(gè)司機(jī)吉野千惠。千惠抱怨最近老是頭昏，頭痛。而她的丈夫卻沒(méi)有提醒小心路上斷層的事情才導(dǎo)致了之前的驚險(xiǎn)。小蘭總覺(jué)得千惠丈夫的態(tài)度有些奇怪。在拜訪千惠家的時(shí)候小蘭她們得知千惠的丈夫?yàn)樗?gòu)買(mǎi)了一千萬(wàn)日元的保險(xiǎn)，疑團(tuán)逐漸增多。經(jīng)過(guò)調(diào)查，千惠丈夫的意圖最終暴露出來(lái)。

被害的真紀(jì)的因?yàn)殄X(qián)包不見(jiàn)了，被疑為是強(qiáng)盜殺人。乍看之下雖然像是強(qiáng)盜殺人，柯南卻肯定兇手是這些大學(xué)生一行人中的某人。雖然懷疑藤浩的不在場(chǎng)證明是否可以確立，這時(shí)這一行人中復(fù)雜的人際關(guān)系一點(diǎn)一點(diǎn)浮現(xiàn)出來(lái)。這次的殺人事件中，隱藏著另外一個(gè)邪惡的計(jì)劃。在“沉睡的小五郎”的解說(shuō)下兇手最終浮出水面來(lái)。

柯南將小五郎麻醉并召集島上的所有人，準(zhǔn)備將真相公之于眾，但遲遲未見(jiàn)和葉和服部的身影，在警察的催促中，柯南只好開(kāi)始對(duì)整個(gè)案件進(jìn)行推理，雖然門(mén)脅和祿郎最有可能犯案但柯南卻首先排除了他們二人的嫌疑，而當(dāng)他指出真兇時(shí)，在座之人無(wú)一不感到震驚，這時(shí)，自救成功的服部及時(shí)趕到推理現(xiàn)場(chǎng)，更是說(shuō)出了一個(gè)讓兇手都意外的事實(shí)。

柯南他們接受了委托，決定去解開(kāi)似乎與穿紅色夾克衫的自殺者有關(guān)聯(lián)的公文包之謎，在去葵屋旅館的途中，遇見(jiàn)了山村刑警于是一起前往。小五郎等人到達(dá)旅館后，卻聽(tīng)說(shuō)已經(jīng)有個(gè)自稱“毛利小五郎”的人先到了旅館，不久之后卻發(fā)現(xiàn)假冒的小五郎在自己的屋子里上吊死亡了。而在死者的隨身物品中有一份過(guò)期的報(bào)紙和夾在其中的頭發(fā)，在柯南的提示下小五郎解開(kāi)頭發(fā)的秘密慢慢接近真相。