柯南等人循著灰原留下的記號(hào)一路尋找，因?yàn)閮词志驮谕械娜C人之中，灰原和光彥就在大樹(shù)下面留下一些散落的蘑菇作為暗號(hào)，躲在叢林里期望柯南能有所行動(dòng)制服兇手。柯南果然不負(fù)眾望，破解了灰原留下的暗號(hào)，正準(zhǔn)備麻醉兇手時(shí)，卻又有所猶豫，并大聲喊出了灰原和光彥，柯南到底有何用意？

和葉與服部帶小蘭他們游大阪的時(shí)候遇到了一個(gè)特殊的旅行團(tuán)，他們都是豐臣秀吉的崇拜者，因此在團(tuán)隊(duì)中大家都扮演不同的角色，但柯南等人卻惟獨(dú)沒(méi)有見(jiàn)到“豐臣秀吉”。然而沒(méi)過(guò)多久，有個(gè)人滿身是火的從天守閣上墜落死亡，而此人正是旅行團(tuán)中的“豐臣秀吉”，服部和柯南在尸體周圍找到了碎片和一個(gè)卷軸，這時(shí)，和葉說(shuō)這和十三年前發(fā)生的焦尸案一樣，雖然沒(méi)有什么頭緒，但柯南和服部斷定這一定和豐臣秀吉的寶藏有關(guān)。

小五郎的事務(wù)所里來(lái)了一個(gè)叫春菜的大學(xué)生，委托小五郎找他的尋呼機(jī)朋友。春菜保存了秋悟先生的尋呼機(jī)和音樂(lè)盒，那以后，春菜的尋呼機(jī)上出現(xiàn)了奇怪的留言。小五郎一行找到秋悟的家人，卻發(fā)現(xiàn)秋悟在給春菜送出尋呼機(jī)之前就已經(jīng)死了，而走廊上還出現(xiàn)了奇怪的人影。接著眾人就發(fā)現(xiàn)已經(jīng)被擊暈的阿稔。

茂木認(rèn)為小五郎是兇手而開(kāi)槍將他射傷，當(dāng)前來(lái)“黃昏別館”的所有名偵探都命喪黃泉時(shí)，電腦上居然出現(xiàn)了一行關(guān)于寶藏的信息，一直躲在監(jiān)視器操控室的神秘幕后黑手終于按捺不住露出了真面目，沒(méi)想到這個(gè)人居然是……柯南引導(dǎo)她說(shuō)出了整件事的真相，而這時(shí)，本應(yīng)死去的偵探們居然都出現(xiàn)在門口，可到底是怎么回事？這棟別墅的寶藏又是什么？

受不住母親一再的嘮叨佐藤警官?zèng)Q定去相親，來(lái)到相親地點(diǎn)出現(xiàn)的竟是白鳥(niǎo)警部！得知這一情況的由美讓暗戀佐藤已久的高木去找佐藤。本來(lái)是準(zhǔn)備相親中途借口逃走的佐藤警官被激與白鳥(niǎo)警部約定，如果日沒(méi)之前高木還沒(méi)來(lái)就與白鳥(niǎo)結(jié)婚！將就在高木急急忙忙前來(lái)的過(guò)程中居然遇到了便利店強(qiáng)盜。不愿看到有情人擦肩而過(guò)的柯南決定出手幫助高木！