京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內(nèi)外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀(jì)曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻(xiàn)書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動(dòng)下，將顏驥全家賜死。紀(jì)曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點(diǎn)燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨(dú)特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認(rèn)為一切都因紀(jì)曉嵐而起，決定替父報(bào)仇，紀(jì)曉嵐扮作戲子，在戲臺(tái)之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

乾隆、和珅以及紀(jì)曉嵐將真相告訴太后，太后賜如玉無罪。得知皇上要召自己入宮，如玉婉拒。朱公公在和珅的指使下告訴戴沾，其在獄中所寫文章均被馮姓編纂官據(jù)為已有。戴沾氣憤不已，與馮扭打在一起，失手將馮打昏。戴沾外出求救時(shí)，朱公公將馮打死，陷害是戴沾所為。和珅轉(zhuǎn)而找到如玉，答應(yīng)其入宮之后即免戴沾死罪。如玉為救戴沾，答應(yīng)入宮。紀(jì)曉嵐設(shè)計(jì)詐朱公公說真相，戴沾被釋放。得知如玉為救自己而嫁入宮中，戴沾不顧一切聞人宮中。太后得知真相后赦戴沾無罪。皇上也成人之美，賜戴沾、如玉成婚。內(nèi)務(wù)府齊蘇圖家出殯。民工古大力因?yàn)楸积R家拖欠工錢而耿耿于懷，帶領(lǐng)眾民工在半路突襲出殯隊(duì)伍。棺材落地，撤出一地的金銀珠寶，其中還有印有內(nèi)務(wù)府字樣的國庫元寶，惟獨(dú)不見尸體。齊蘇圖伯自己私吞國庫銀兩的罪行敗露，便殺死老仆齊平假裝出葬之人。受賄于齊家的和珅在朝上將罪責(zé)推到對手順天府尹身上，責(zé)其治安不利，使死者暴尸街頭。順天府尹因?yàn)閼赜诤瞳|的yin威而承認(rèn)自己失職。

客棧老板以假當(dāng)真，錯(cuò)把紀(jì)曉嵐當(dāng)作是戶部尚書、當(dāng)今皇上的心腹寵臣和，趕緊偷偷稟報(bào)燕城統(tǒng)領(lǐng)，卻搞得這幫人十分為難，不知如何接待，才能既表了“忠”心，又不拂逆了“和大人”的本意。 和以穩(wěn)定江山社稷為理由，鼓舌如簧，誘騙十四王爺上鉤，抗旨離開云州赴燕城；四姑娘則借助福康安對自己的單相思，弄清了這是一個(gè)陰謀。但她報(bào)仇心切，決定將計(jì)就計(jì)，索性把一片癡情的福康安挾為人質(zhì)，作為解救王爺?shù)捻来a。 在皇上的授意與允諾下，紀(jì)曉嵐把和的官印做了調(diào)換，本意是使燕城之行在萬不得已時(shí)可以順利進(jìn)行。不想客棧內(nèi)再次與那些守城的衙役相遇時(shí)，此人竟嚇得面無人色，急忙作揖打恭求饒不已，而燕城和府劉常富率隨從必恭必敬盛宴款待，也讓他對和與此地貪污案關(guān)系有了更深懷疑。索性將錯(cuò)就錯(cuò)，以和之名，借機(jī)盤查一些不易為外人所知的內(nèi)幕。

紀(jì)曉嵐夜讀時(shí)又接到被扔進(jìn)窗子的紙條，上面寫有郭天的消息，紀(jì)曉嵐懷疑黑衣人正是張了了。紀(jì)曉嵐夜探郭天，得到通報(bào)的和珅與盧焯眼見沒有退路，只得慌忙扮成囚犯躺在隔壁囚房。乾隆看到瑤琴乘坐的馬車很是欣喜，不料落入盧安的圈套，也被一同押走。乾隆三人被關(guān)在洞中，外面重兵把守。乾隆佯裝自殺以騙過盧安，再見機(jī)救出瑤琴。紀(jì)曉嵐終于醒悟，誓要擺脫情感糾葛，全力調(diào)查國庫虧空一案。紀(jì)曉嵐扮作江湖郎中，偶遇掌管賬本的宋司庫，以自己掌握的情況博得宋司庫信任，并抓住其惶恐的心理，以消災(zāi)為由取得真賬本。和珅模不透紀(jì)曉嵐葫蘆里賣的是什么藥，便決定先下手為強(qiáng)，命盧安將瑤琴押回杭州以要挾郭天認(rèn)罪，卻沒料到乾隆在盧安即將動(dòng)身時(shí)救出瑤琴。

紀(jì)曉嵐拿到賬本后隱隱不安，果然有人趁紀(jì)曉嵐不備時(shí)搶走賬本。乾隆和瑤琴經(jīng)過生死磨難，已是兩情相悅、不能自已。收到張了了送來的賬目，和珅將假賬目交與盧焯以做郭天貪污的證據(jù)，由于瑤琴被救，和珅與盧焯決定改變計(jì)劃，同意郭天自盡，對外宣稱其是畏罪自殺。乾隆藥醒，得知自己身份已暴露，干脆帶瑤琴趕往浙江營救郭天。劉全再次用柳哥要挾張了了，讓其做偽供，佯稱和珅給盧焊的假賬目是從紀(jì)曉嵐身上搶走的真賬目。瑤琴擊鼓鳴冤，和珅與盧焯見乾隆駕到慌忙升堂。乾隆堂上審訊，和珅與盧焯讓張了了出面，試圖將責(zé)任推到紀(jì)曉嵐身上而瞞天過海，誰知紀(jì)曉嵐拿出真賬本，并聲稱自己早已有所防備，張了了搶走的只是副本。