毛利小五郎受久須美工械廠社長(zhǎng)的委托，調(diào)查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對(duì)職員們暗中調(diào)查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對(duì)象，三人計(jì)劃在倉(cāng)庫(kù)抓住罪犯的現(xiàn)行，不料卻發(fā)現(xiàn)谷崎死在了反鎖的房間里。正當(dāng)案件一籌莫展時(shí)，谷崎生前研究的老鼠機(jī)器人引起了柯南的注意。

小五郎讓柯南和小蘭陪他一起去位于大分的別府溫泉旅行，說(shuō)到別府溫泉最有名的莫過(guò)于地獄巡游之旅，就在小蘭和柯南興致勃勃討論的時(shí)候小五郎卻在一旁默不作聲。在柯南和小蘭的逼問(wèn)下小五郎才說(shuō)出了實(shí)情，這次的旅行目的是尋找仲代電氣社長(zhǎng)的女兒麻奈美，柯南根據(jù)照片找到了麻奈美所住的旅館，但這僅僅只是開(kāi)始。

練習(xí)空手道的京極曾在幼時(shí)受到高見(jiàn)達(dá)人的指點(diǎn)，高見(jiàn)老師的教誨才成就了如今的京極，京極拜訪老師道館的時(shí)候園子拖著柯南也來(lái)參觀。高利貸催款的人來(lái)到了道場(chǎng)，得知老師要賣(mài)掉道場(chǎng)引退后京極非常反對(duì)，京極出去沒(méi)多久就聽(tīng)到了玻璃破碎的聲音，一行人沖出去后發(fā)現(xiàn)道館內(nèi)寶貴的黑帶不見(jiàn)了。

一直被大家遺忘在家中的狗引起了柯南與平次的注意，二人很快就洞察了這一系列殺人事件的作案手段。平次委托村長(zhǎng)告訴眾人他已經(jīng)得知了鵺的真面目，并在庭院內(nèi)為眾人重新演示了一遍案發(fā)當(dāng)日的情形。在二人的推理下真相終于浮出水面，兇手成功被警方抓獲。當(dāng)案件塵埃落定后，平次終于鼓起勇氣準(zhǔn)備向和葉告白……

若狹老師不慎將話(huà)劇演出要用的屏風(fēng)弄臟，柯南一行跟著若狹老師回到公寓幫忙重畫(huà)，完工后隔壁房間傳來(lái)了噪音，元太和柯南前去抗議時(shí)遇到了新的案件。死者是一名模特，而她的男友是有名的高爾夫運(yùn)動(dòng)員，若狹老師在早上聽(tīng)到了兩人的爭(zhēng)吵，而柯南已經(jīng)確定了誰(shuí)是兇手，現(xiàn)在只差找到關(guān)鍵的證據(jù)。