少年偵探隊(duì)按照暗號(hào)分別找到了剩下的兩個(gè)時(shí)光保存罐，卻發(fā)現(xiàn)在此之前有人曾將它們挖出來過而且最后一個(gè)發(fā)現(xiàn)的時(shí)光保存罐里面竟然有一封信，將所有的字條擺在一起，真相也愈發(fā)明晰，柯南在阿笠博士的幫助下揭露了真兇，沒想到事情的癥結(jié)可以追溯的十五年前……

柯南在車上發(fā)現(xiàn)了一封信后，就更加肯定兇手是這個(gè)叫三角的人，可他到底使用了什么樣的犯案手法？就在柯南百思不得其解時(shí)，瑛祐突然大叫，原來他的手被擋風(fēng)玻璃的碎片劃傷，小蘭拿出OK繃給他包扎，這時(shí)，柯南靈光一現(xiàn)，知道了兇手的犯案手法，他利用老方法將小五郎麻醉，沉睡的小五郎再次出馬。

按照慣例，家里如果有人死去就要演奏安魂曲，于是，羽賀開始了他的演奏，就在大家沉浸于琴聲之中時(shí)，蓮希的奶奶突然從樓上墜落，警方在案發(fā)的房間里發(fā)現(xiàn)了被摔壞的仿品斯托拉地巴力毆斯以及窗邊的椅子，于是認(rèn)為，蓮希奶奶很有可能是自殺，但是一夜之間發(fā)生兩起命案，并且死者都是在密室中死亡，難道是小提琴的詛咒再次應(yīng)驗(yàn)？

阿笠博士帶著少年偵探隊(duì)來到岡山縣倉敷市展開了一場(chǎng)古代史之旅，他們?cè)谶@里結(jié)識(shí)了因同學(xué)會(huì)而重新聚在一起的五名男女，然而就在大家按照撿來的暗號(hào)進(jìn)行尋寶時(shí)，卻發(fā)現(xiàn)那五人中的一人突然死亡，另外一個(gè)則被當(dāng)做重要關(guān)系人接受調(diào)查，根據(jù)少年偵探隊(duì)所找到的時(shí)光保存罐以及死者留下的死亡訊息，柯南斷定兇手就在剩下的四人中，但要抓住真兇，就必須要找到其他兩個(gè)時(shí)光保存罐。

柯南和服部必須在第九局下半場(chǎng)前解開暗號(hào)，可是時(shí)間已經(jīng)不多，這個(gè)空白暗號(hào)到底代表著什么，這時(shí)，柯南靈光一現(xiàn)想起了看臺(tái)上所缺少的17和22號(hào)門，但情況危急，必須爭分奪秒，之后服部和柯南推斷出了暗號(hào)所指的位子，沒到竟然就在小蘭她們附近，三人緊忙跑去，果然找到了第三支手機(jī)，根據(jù)手機(jī)上的數(shù)字，柯南很容易就找到了這個(gè)甲子園惡魔的位置，而他又有什么樣的苦衷？