柯南，小蘭和小五郎一行三人到飯店避暑，正巧在這里碰到了和其他律師一起來(lái)這里度假的妃英理，當(dāng)晚為了找尋酒醉未歸的小五郎，竟然發(fā)現(xiàn)了死在密室里的律師律子，然而糟糕的是，小五郎竟然就睡在這個(gè)房間里，于是小五郎就以案件重要關(guān)系人的身份被帶回了群馬縣警局，佐久作為辯護(hù)律師一同前去，而柯南和妃英理等人則留在現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行調(diào)查。

小五郎等人在去海豚樂(lè)園的路上，遇到了幾位正在進(jìn)行大學(xué)同學(xué)聚會(huì)的女子。為了接另一位大學(xué)同學(xué)，他們一起前往海豚樂(lè)園飯店卻意外發(fā)現(xiàn)她們等待已久的藤村直美被殺害了。經(jīng)過(guò)調(diào)查之后柯南確認(rèn)了兇手的身份并向大家演示了兇手利用雪糕的犯罪手法。再自己留下的證據(jù)面前，兇手最終承認(rèn)了罪行。

柯南，小蘭與小五郎向著溫泉的途中，在遭苛政君主殺害的戰(zhàn)國(guó)武將沖滑秀友的墓前祭祀時(shí)。正巧結(jié)識(shí)了住在這里的一戶人家。還聽(tīng)說(shuō)了關(guān)于秀友鎧甲的詛咒的傳聞。接著那天夜里。也正是秀友500年祭日的那晚，還知道了當(dāng)天也是這家人家中的父親因工廠倒閉即而自殺，即這個(gè)鎧甲原來(lái)的主人的祭日。

在收集線索時(shí)，柯南并沒(méi)有像以前一樣提出很多的質(zhì)疑，反而竭盡全力的反駁服部的推測(cè)，之后他們?cè)谀硞€(gè)房間里發(fā)現(xiàn)了本不該出現(xiàn)在這里的拖把，有了這樣?xùn)|西，兇手的犯案手法就完全被破解了，但柯南仍然不甘心自己的這種猜測(cè)，于是他想要找到能推翻自己想法的證據(jù)，然而，事與愿違，越是深究事情就越是向自己不愿承認(rèn)的方向發(fā)展，面對(duì)如此不可置信的真相，柯南又該作何選擇？

茂木認(rèn)為小五郎是兇手而開槍將他射傷，當(dāng)前來(lái)“黃昏別館”的所有名偵探都命喪黃泉時(shí)，電腦上居然出現(xiàn)了一行關(guān)于寶藏的信息，一直躲在監(jiān)視器操控室的神秘幕后黑手終于按捺不住露出了真面目，沒(méi)想到這個(gè)人居然是……柯南引導(dǎo)她說(shuō)出了整件事的真相，而這時(shí)，本應(yīng)死去的偵探們居然都出現(xiàn)在門口，可到底是怎么回事？這棟別墅的寶藏又是什么？