這天小五郎和柯南看到警車駛過(guò)，便和目暮警官一同趕往殺人現(xiàn)場(chǎng)。原來(lái)是公寓的某屋內(nèi)發(fā)現(xiàn)了小說(shuō)家齊川村子的尸體。死因是頭部被物品打擊致死。發(fā)現(xiàn)尸體的是迷宮出版社的編輯遠(yuǎn)野舜一和公寓管理員村田啟三。遠(yuǎn)野說(shuō)齊川之前收到了恐嚇的明信片。而在警方的調(diào)查下柯南最終發(fā)現(xiàn)了犯人的真面目。

簡(jiǎn)單問(wèn)過(guò)案情之后，小五郎隨警方來(lái)到案發(fā)的二樓進(jìn)行查看，根據(jù)死者頭部的槍傷，推斷出兇手的身高應(yīng)該在在180cm左右，雖然船本先生有嫌疑但卻低于死者，種種推斷都否決了船本殺人的可能，然而，柯南卻在他輪椅上發(fā)現(xiàn)了蔥，沒(méi)錯(cuò)，兇手就是他，可是他到底是如何犯案？消失的珍珠項(xiàng)鏈又被如何處理了？

少年偵探團(tuán)聽(tīng)同學(xué)說(shuō)她們家的房客中有一個(gè)十分刻板且循規(guī)蹈矩的男人，尤其是遇上亂扔垃圾的人就會(huì)對(duì)他們訓(xùn)斥一番，出于好奇，柯南他們便前去見(jiàn)這個(gè)叫巖田的先生。沒(méi)想到三天之后，巖田居然去警局自首說(shuō)自己失手殺人，雖然是正當(dāng)防衛(wèi)不予追究，但警察還是對(duì)巖田的生活以及他的朋友等人進(jìn)行了調(diào)查，卻發(fā)現(xiàn)事情并不像他描述的那么簡(jiǎn)單。

根據(jù)這個(gè)如此漏洞百出的犯案現(xiàn)場(chǎng)，柯南推斷前來(lái)拿走照片的人并不是黑暗組織，為查明真相，柯南讓店長(zhǎng)分別給三個(gè)有備份鑰匙的人打電話詢問(wèn)他們的行蹤，卻并未發(fā)現(xiàn)有何異樣，然而，一切都逃不過(guò)柯南敏銳的眼睛，他將凳子上汗?jié)n與這三個(gè)人是身形相聯(lián)系，斷定拿走照片的人就在他們之中并且這個(gè)人現(xiàn)在就在房間里。

小蘭和園子去吃帶上小學(xué)生才能打折的巨龍之山奶油圣代。柯南覺(jué)得無(wú)聊去商場(chǎng)廁所時(shí)看到了高木、千葉和5歲的人質(zhì)結(jié)誠(chéng)佳代子的媽媽?？履先サ叵峦＼噲?chǎng)解救了佳代子，卻反被殺人犯大嶺良介當(dāng)人質(zhì)劫車帶走。小蘭找來(lái)了毛利小五郞救柯南。車上，柯南得知大嶺在涉谷開(kāi)搶殺了柔道黑段、經(jīng)常拖欠工人工資而引發(fā)金錢糾紛的恩田和美。原因是替開(kāi)發(fā)過(guò)許多游戲卻沒(méi)得到應(yīng)得數(shù)目的工資的朋友金山報(bào)仇?？履掀髨D逃走，黑暗中有人對(duì)柯南開(kāi)槍，大嶺救了柯南，柯南找來(lái)阿笠博士幫忙掩護(hù)。在毛利的調(diào)查中，幕后嫌疑人有三個(gè)。。。