就在兇手企圖用球棒襲擊被騙到音樂(lè)室的小林老師時(shí)，他卻反過(guò)來(lái)被小林老師撂倒，這時(shí)，少年偵探團(tuán)和白鳥(niǎo)警官出現(xiàn)，原來(lái)小林老師早已被白鳥(niǎo)警官所保護(hù)而眼前這個(gè)人正是佐藤警官，期間，小林老師想起了以前在書(shū)店發(fā)生的事情，誤會(huì)消除的二人重歸于好。麒麟角是鈴木次郎吉在山中寺廟發(fā)現(xiàn)的寶物，而基德又以此為目標(biāo)出了預(yù)告函，次郎吉率領(lǐng)基德無(wú)法喬裝的少年偵探團(tuán)以及進(jìn)行直播的工作人員來(lái)到寺廟，麒麟像被藏在寺廟的立柱中間，想要拿取它并非易事……

小五郎受到一個(gè)名叫立李三可的委托，帶著柯南和小蘭一起來(lái)到群馬縣調(diào)查真相，途中他們遇見(jiàn)了德備六朗和荒巖，并從他們口中得知了11年前有一個(gè)名叫辰彥的孩子在旅館附近的河中溺斃而亡的事件，這與信中所提及的殺人案有何聯(lián)系？辰彥父親同時(shí)也是約見(jiàn)地點(diǎn)光羅旅館的老板沼山伴藏也讓人覺(jué)得很怪異，次日清晨，滿身都是刺鼻氣味液體的伴藏死在了旅館的頂樓房間，難道是小蘭昨晚在河邊看到的河童下的毒手嗎？

大和警官和柯南等人立刻找到剩下的三個(gè)嫌疑人展開(kāi)詢問(wèn)，可是每個(gè)人都有不在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的證明，與此同時(shí)，只身一人在公館思考赤壁之謎的高明遭到了兇手的襲擊，在失去意識(shí)之前他向大和傳了一條“孔明之死”的訊息，當(dāng)柯南他們趕到公館后這里已是熊熊大火，所幸上原由衣及時(shí)將高明救出，把他送到醫(yī)院的時(shí)候，小蘭對(duì)醫(yī)生們不同顏色的衣服表示好奇，而這個(gè)問(wèn)題正好給了柯南和大和提示，讓他們破解了赤壁之謎！

傳說(shuō)中駕駛白色FD橫掃冬名山的銀白魔女，引起了小五郎調(diào)查的興趣，于是，他帶著柯南和小蘭向冬名山進(jìn)發(fā)，濃霧彌漫的山中魔女的FD果然出現(xiàn)了，小五郎拼命追趕，而魔女卻消失在沒(méi)有路的云霧之中，他立刻與正在盤(pán)查的山村警官聯(lián)系并攔下了所有的白色FD，有三組車(chē)手接受了盤(pán)查，銀白魔女是否就在他們之中？

雖然根據(jù)收據(jù)知道了這13件t恤是在每個(gè)周日的12：28所購(gòu)買(mǎi)的物品，但專柜的銷(xiāo)售員卻不記得購(gòu)買(mǎi)人的長(zhǎng)相，與此同時(shí)，柯南從t恤上奇怪的折痕調(diào)查出了十多年前的登山家遇難事故，而這似乎與這起爆炸事件有特殊的關(guān)聯(lián)，就在人質(zhì)們開(kāi)始躁動(dòng)的時(shí)候，柯南將小五郎麻醉，并指出了放置炸彈的幕后黑手，而他就是……