京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動下，將顏驥全家賜死。紀曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認為一切都因紀曉嵐而起，決定替父報仇，紀曉嵐扮作戲子，在戲臺之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

左山傀無意中提到香積庵，紀曉嵐與趙青前去探訪。考場之外，和珅與敏德三人當著小月做出嚴查之勢，實則根據考生文具上的標記，使那些花錢作弊的考生順利進入考場。正當和珅得意之時，紀曉嵐趕到，將敏德手下負責搜檢考生的兵丁全部調換，并重新進行檢查，將已經蒙混過關的考生查出。趙青詫異于吳盛欽沒有參加恩科考試，吳盛欽卻表示自己以重金賄賂考官，不用考試也能坐上官椅。和珅發現趙青欲找紀曉嵐告發此事，便派人將其劫持到香積庵以滅口。和珅等人本以為考試結束便萬事大吉，誰知紀曉嵐提出為了避免考生在試卷上留暗語作弊，要找人重抄試卷。正當趙文龍及眾閱卷官不知如何是好時，左山傀想出一計。

一日，皇上在和、紀曉嵐與小月的陪伴下，到號稱人間天堂的杭州游玩，西子湖畔，伶牙俐齒的小才女蘇卿憐受義父，原甘肅知府，新調江浙總督的王旦望之托要將名畫《清明上河圖》贈送微服便裝的皇上。 八百里加急文書疾至，稟報皇上邊疆遭敵侵犯，和驕矜自負，為討圣上歡心，主動請纓。皇上一方面寄望他能平定邊亂，同時亦能調查清楚朝野內外議論紛紛的“監糧”一案的真偽，并特地為之配了小月、莫愁這兩個“內旨監軍”。 此次杭州之行，決非單純的游山玩水，皇上對紀曉嵐清肅污吏的能力十分欣賞，要他從已在杭州任職的原甘肅知府王旦望身上打開缺口。 王旦望自然不會坐以待斃，他加緊活動，上竄下跳，勾結心腹，串聯口徑。 和帶大批隨從，與小月、莫愁一路風餐露宿，風塵仆仆，大字不識一個的小月行軍途中仍不忘職責，及時巧妙地向皇上傳回奏折。

紀曉嵐口若懸河，矛頭直指十四王爺。其慎密嚴謹的邏輯分析和出類拔萃的語言天才，贏得滿堂注目，王爺眼看走投無路，惟有一死謝罪，硬著頭皮吞下“回春丹”，咽了茶，卻不想又落入紀曉嵐的圈套，貽笑大方。 和與福康安對紀曉嵐此番搶了頭功頗為不悅，又暗暗慶幸自己的非法作為未被追究。來日方長，誰知道下一回合又是誰占上風。 一日，和以一古硯巴結皇上，紀曉嵐慧眼如炬，制為贗品，和氣得發昏，發誓要搞到稀世珍品，即再次上當，在皇上面前苦不堪言，但他亦非酒囊飯袋，亦會巧施小計難為紀曉嵐。只是魔高一尺道高一丈，紀曉嵐敏學巧思，以絕頂聰明之頭腦免去了為其更衣脫靴之難堪，反贏得皇上哈大笑。 福康安向和奉上一本《紅樓夢》，誣為反清復明的作品，因作者之妻與紀曉嵐聯系，不怕從中找不到紀曉嵐的把柄，和趁皇上、太后去泰山祭拜之前，大進讒言，詆毀《紅樓夢》，皇上被其鼓惑，草率地下令查禁此書。莫愁閑來無事，散步街頭，忽見一白衣秀發女子被官兵追殺，行俠仗義之心油然而生。

為避免和珅從中舞弊，紀曉嵐自薦調查此事。紀曉嵐推薦不畏權勢的海升進行調查。和珅讓劉三盡快將煤窯脫手，劉三似有難言之隱。小月假扮皇室之人，與海升進山察探，表示要買下煤窯并約劉三在酒樓詳談。劉三得知后暗自慶幸，迫不及待地前去和海升商談買賣煤窯之事，被早已等候于此的紀曉嵐捉拿歸案。和珅表示自己查出劉三是開窯之人，并要求紀曉嵐從嚴查處，以示自己秉公執法。眾人規勸海升看在和珅的面上放過劉三，以給自己留后路，海升堅持要秉公處理，和珅擔心劉三供出真正的幕后主使而連累自己，于是命劉三服毒自盡。海升欲繼續調查，卻得知劉三已死并被家人拉回老家埋葬。