為了讓扭傷腳的柯南療養(yǎng)腳傷，大伙兒一起來到城崎溫泉，然而，小蘭卻突然失蹤，柯南從光彥他們所拍的照片上看到小蘭和一個小女孩在一起，同時照片上還出現(xiàn)了一個行蹤可疑的男人。這時，柯南他們遇到了服部，他受人委托前來找一個叫陽菜的女孩，而她正是和小蘭在一起的那個孩子。據(jù)陽菜的父親周平所說，在陽菜失蹤的同時他美術(shù)館里的展品彩虹之子也不翼而飛。就在大家四處進行尋找時，陽菜和小蘭遇到了危險。

君島帶著自滿的藏平來參加電視節(jié)目，但在彩排時花瓶卻離奇失蹤！作為名偵探的小五郎也身負(fù)重任來尋找失蹤的花瓶。而在分析眾人之后小五郎發(fā)現(xiàn)舉止怪異的山崎，但山崎藏起來的是洋子的手絹而非花瓶。而在調(diào)查了現(xiàn)場之后柯南發(fā)現(xiàn)了犯人偷藏花瓶的手法，并以小五郎的身份揭露了犯人的身份。而君島帶來的花瓶也只是贗品而已。

小五郎，柯南和小蘭三人在前往泡溫泉的路上遇到了一起交通意外，其中駕駛紅色車子的速水當(dāng)場死亡，另一位車主車谷整司則身受重傷，據(jù)當(dāng)?shù)亟痪f發(fā)生車禍的原因可能是因為沖撞路線現(xiàn)象，但柯南卻并不認(rèn)為這是單純的交通事故，因為他之前曾在便利店見過這兩輛車子，當(dāng)時明明是開往不同的方向為什么會如此巧合的發(fā)生相撞，調(diào)查之后，事情果然如他料想一般，這是一起有預(yù)謀的殺人案。

這兩人竟然是長野縣警官上原由衣和大和敢助，他們此次前來的目的是讓柯南和小五郎幫忙破解沾滿鮮血的赤壁之謎！于是一行人來到案發(fā)的希望之館，這里曾經(jīng)住著六個很有才華的年輕人，自從三年前一名女性小葵心臟病發(fā)去世之后，她的丈夫明石周作就獨自一人留在館內(nèi)生活，可是他卻被人鎖在館內(nèi)的屋中活活餓死，如今能看到的只有他留下的奇特死亡訊息，這時，大和警官的死對頭諸伏高明警官也來到館內(nèi)進行調(diào)查。

福爾摩斯啟示錄(0 is start)到了搶七局的關(guān)鍵時刻，米奈芭打出了關(guān)鍵的一球，通過最后一球的拉鋸戰(zhàn)柯南不斷觀察犯人的位置。拉鋸戰(zhàn)之后米奈芭失掉了最后一球就在這時她提出了異議，通過慢鏡頭的回放最終取得了這一局的勝利，而柯南也通過拉鋸戰(zhàn)找到了犯人所在的位置。在父母的幫助下柯南順利的進入賽場。就在柯南要制止罪犯之時卻被人認(rèn)了出來，最終米奈芭和柯南聯(lián)手組織了罪犯。