接受汀小姐的邀請(qǐng)小五郎一行人來到了大濱海岸，在汀小姐的家里小五郎等人遇到了她的丈夫海四郎，兩人因?yàn)闆_浪的事情起了爭(zhēng)執(zhí)。傍晚海四郎找到小五郎等人表示汀小姐不見了，看到汀小姐發(fā)來的短訊后海四郎先行回到家中，而第二天早上小五郎等人卻在海灘上發(fā)現(xiàn)了汀小姐的尸體，而她的尸體旁邊卻沒有留下任何足跡。

柯南和小蘭跟著小五郎一起參加他的老朋友結(jié)婚前的慶祝會(huì)，在熱鬧的氣氛中新娘加門初音小姐前往美甲沙龍做指甲，但是沒想到兩小時(shí)后初音小姐留下了“永別了”這句話后隨著停車場(chǎng)的爆炸聲變成了一具尸體，從掉落在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的假指甲上采集到的皮屑與新郎伴場(chǎng)的DNA幾乎完全吻合，而初音小姐雇來的偵探安室透也將事件的矛頭對(duì)準(zhǔn)了伴場(chǎng)。

少年偵探團(tuán)利用連休來到了京都，他們是為了乘坐神盾艦體驗(yàn)航海的樂趣，但跟著他們一起前來的園子、小蘭和小五郎卻對(duì)小吃和酒更感興趣。京都的日式甜點(diǎn)是小蘭非常喜歡的甜點(diǎn)，但她購(gòu)買的老店中卻沒有了巧克力口味，慌忙跑進(jìn)來的社長(zhǎng)竟然稱所有分店的巧克力口味都憑空消失了，聽到小五郎名號(hào)的社長(zhǎng)急忙拜托調(diào)查。

柯南一行人在阿笠博士的陪同下一起去山上露營(yíng)，在柯南和博士前去買東西時(shí)碰巧遇到了世良真純。另一方面，在山上撿拾柴火的灰原等人碰到了正在掩埋尸體的可疑人物，無法與柯南聯(lián)系的他們只能逃到了山中的小木屋內(nèi)，但讓他們沒想到的是這里便是兇案的事發(fā)現(xiàn)場(chǎng)，在柯南等人開始調(diào)查三個(gè)有嫌疑的人時(shí)小木屋卻燒起來了。

現(xiàn)場(chǎng)的鄰居是前男友（前篇）