電視臺(tái)要制作與小五郎24小時(shí)密切接觸的電視節(jié)目，為了討論節(jié)目?jī)?nèi)容，小五郎帶著柯南和小蘭隨節(jié)目制作公司的社長(zhǎng)染井彰吾一起前往東都電視臺(tái)制作人中目賴策的家中商討方案，沒想到大門竟然上了鎖而且按門鈴也沒有回應(yīng)，于是請(qǐng)來(lái)管理員打開門進(jìn)入公寓，出現(xiàn)在他們眼前的是因喝下毒咖啡而身亡的中目的尸體，從在桌面和地面上打翻的咖啡痕跡，柯南看出這是一起密室殺人案。

柯南、小蘭和小五郎一起去逛商場(chǎng)，沒想到書店附近傳來(lái)了一聲尖叫，只見一名男子渾身是血昏倒在地，接到電話的警方火速趕到并立刻封鎖現(xiàn)場(chǎng)，期間柯南和偶遇的灰原從一名小偷那里得知了歹徒的些許信息，之后，二人又對(duì)樓上的牙科診所進(jìn)行了調(diào)查，根據(jù)搜集到的信息，他們鎖定了目標(biāo)，就在歹徒企圖再次傷人時(shí)，警察及時(shí)趕到。

兇器是房間工具箱里的錘頭，并且柯南還發(fā)現(xiàn)每個(gè)人的房間都有薰衣草和工具箱，到底是誰(shuí)做出這種安排？又是出于什么目的呢？既然是無(wú)人島，那么兇手一定就是這棟房子中的一人，之后柯南他們又對(duì)供電的小房子進(jìn)行了調(diào)查，然而根據(jù)所找的線索，柯南，服部和白馬探每個(gè)人鎖定的嫌犯都不相同，即便如真相也只有一個(gè)！

在FBI制定作戰(zhàn)計(jì)劃的同時(shí)黑暗組織就已經(jīng)展開了行動(dòng)，他們以南田陸道的名義寄給FBI一盆花，就在柯南推測(cè)敵人的意圖時(shí)，杯戶中央醫(yī)院突然涌來(lái)大波病患，這無(wú)疑也是黑暗組織的安排，在處理完花盆里埋的炸彈后，醫(yī)院陸續(xù)出現(xiàn)送貨員，而這些貨物全部都是黑暗組織送的炸彈，如果醫(yī)院爆炸，后果不堪設(shè)想，柯南和赤井秀一又會(huì)采取什么行動(dòng)？

小五郎、柯南、小蘭和白鳥一行人應(yīng)本城之邀，前來(lái)參加葡萄酒協(xié)會(huì)會(huì)長(zhǎng)廣瀨的70歲壽宴。宴會(huì)開始前，柯南和小蘭兩人遇到了發(fā)生爭(zhēng)執(zhí)的本城和赤丸，并且在搭乘纜車的時(shí)候，柯南還目睹了本城殺害赤丸的場(chǎng)景，于是，他迅速趕往現(xiàn)場(chǎng)，卻發(fā)現(xiàn)尸體早已被本城轉(zhuǎn)移。然而，品酒環(huán)節(jié)的一個(gè)紕漏，讓柯南推斷出了事情的真相，他巧妙用計(jì)將本城的罪行公之于眾。