趁警察不注意工藤逃到阿笠博士那里尋求幫助，這時擔心工藤的小蘭找也找到這里，為保護小蘭安全，工藤隱瞞身份并在情急之下取名江戶川柯南，阿笠博士將柯南托付給小蘭照顧，回家后他們碰到了急匆匆出門辦案的毛利小五郎，聽說有黑衣人，柯南也跟著一起去。原來是董事長女兒谷晶子被綁架，在管家承認了自己是犯人且沒有同伙后，卻再次有人打來威脅電話……

周瑜（洪宇宙飾）設計殺劉備不得，又被諸葛亮（唐國強飾）設計，氣得舊傷復發，在柴桑養病。孫權（吳曉東飾）派人向曹操表奏劉備（孫彥軍飾）為荊州牧，本想引起曹操和劉備的爭端。但是曹操（鮑國安飾）反而表奏周瑜為南郡太守，意圖讓孫劉兩家在荊州開戰，坐收漁利。周瑜設計假借攻打西川以換荊州，乘勢殺劉備。諸葛亮早已看破，將計就計，反而再氣周瑜，周瑜身亡。

孫權（吳曉東飾）請諸葛亮（唐國強飾）議事，諸葛亮稱曹兵有百萬雄師，不如量力而行，以求茍活。孫權大怒，拂袖而去。魯肅告訴孫權諸葛亮其實已有破曹之計，孫權恍然大悟是自己器量太小，于是后堂請諸葛亮細談軍事。戰與不戰孫權最終請周瑜（洪宇宙飾）來做決定。周瑜欲與曹操一戰決心已定，但為試探諸葛亮，表面還是欲降。諸葛亮用周瑜之妻小喬（何晴飾）為計，激怒了周瑜，于是周瑜決定來日便跟孫權提起兵抗曹之事。

魏軍與蜀軍交兵于祁山，司馬懿（魏宗萬飾）屢次中計，于是閉門不出，以逸待勞。劉禪恢復了諸葛亮丞相的職位，但這時諸葛亮的身體已經大不如前。諸葛亮設計引魏軍出戰，司馬懿與諸葛亮斗智斗勇，知道這是諸葛亮的誘敵之計，于是分兵兩路夾擊蜀軍，諸葛亮也做好了周密的部署，分兵四路對抗魏軍。此時魏延（王心海飾）已經有了反心。魏軍慘敗。諸葛亮卻重病倒下，全軍撤回漢中。一年后魏軍率兵四十萬直逼漢中，諸葛亮訂下退敵之策準備再出祁山。連降秋雨，魏軍冒雨而退，諸葛亮乘勢再出祁山。

興兵伐吳劉備因關羽之故，手足之情興兵伐吳，諸葛亮在阻止劉備無效。此時，張飛趕來，直言劉備忘了往日桃園結義之情，定要自己前往東吳報仇。劉備此時已經決意，要興兵掛孝伐吳。