小五郎的朋友向日葵酒吧的老板井上弘子意外被人殺害，當(dāng)他和柯南趕到案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)時(shí)，弘子的男朋友高岡明已守在尸體旁邊，目暮警官等也展開了調(diào)查，據(jù)周圍人所說，在案發(fā)期間并沒有人出入死者所在的公寓，并且嫌疑人高岡明當(dāng)時(shí)也有充分的不在場(chǎng)證明，就在警方斷定這是起入室搶劫殺人事件時(shí)，柯南發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵線索，他重新推斷死亡時(shí)間，并斷言這里并非案發(fā)的第一現(xiàn)場(chǎng)。

小說家萬田年久在旅館里趕寫小說，在編輯島木催稿離開房間后，萬田化裝成服務(wù)生，帶著貓咪諾貝爾離開了旅館。萬田路過柯南等人打簡(jiǎn)易棒球的場(chǎng)地，進(jìn)入了弟子原本高平的家。萬田從代理作者原本那里得到原稿后，將其殺害了。而偶然將球打入的柯南一行進(jìn)入房間后發(fā)現(xiàn)了被殺的原本。柯南則發(fā)現(xiàn)了萬田的不自然。

小五郎、柯南、小蘭和白鳥一行人應(yīng)本城之邀，前來參加葡萄酒協(xié)會(huì)會(huì)長(zhǎng)廣瀨的70歲壽宴。宴會(huì)開始前，柯南和小蘭兩人遇到了發(fā)生爭(zhēng)執(zhí)的本城和赤丸，并且在搭乘纜車的時(shí)候，柯南還目睹了本城殺害赤丸的場(chǎng)景，于是，他迅速趕往現(xiàn)場(chǎng)，卻發(fā)現(xiàn)尸體早已被本城轉(zhuǎn)移。然而，品酒環(huán)節(jié)的一個(gè)紕漏，讓柯南推斷出了事情的真相，他巧妙用計(jì)將本城的罪行公之于眾。

簡(jiǎn)單問過案情之后，小五郎隨警方來到案發(fā)的二樓進(jìn)行查看，根據(jù)死者頭部的槍傷，推斷出兇手的身高應(yīng)該在在180cm左右，雖然船本先生有嫌疑但卻低于死者，種種推斷都否決了船本殺人的可能，然而，柯南卻在他輪椅上發(fā)現(xiàn)了蔥，沒錯(cuò)，兇手就是他，可是他到底是如何犯案？消失的珍珠項(xiàng)鏈又被如何處理了？

柯南等人急匆匆的跑去米花公園的池塘里看被人丟棄的咬人龜，期間，他們遇見一個(gè)冒牌飼主二本松，雖被識(shí)破但他還是用花言巧語騙過了光彥等人，可讓他沒想到的是池塘里居然會(huì)冒出四只咬人龜，不知出于什么目的，他決定全部收養(yǎng)，柯南覺得二本松的行為很可疑，于是就暗中進(jìn)行調(diào)查，發(fā)現(xiàn)他與一起搶劫案有關(guān)，可他為什么要領(lǐng)養(yǎng)咬人龜？