小五郎竟然拒絕去看沖野洋子主演的新電影，原因是這部電影的原型很像他和妃英理，正當(dāng)他們爭(zhēng)論的時(shí)候小蘭接到了一個(gè)聊天軟件的申請(qǐng)，同意后小蘭竟然收到了媽媽妃英理的求救，就在他們疑惑的時(shí)候另一個(gè)相同的賬號(hào)也加入了聊天，柯南一眼看出妃英理遇到了危險(xiǎn)，而犯人正在擾亂他們的判斷。

為了追蹤倉(cāng)田屋駒吉的下落，柯南等人來(lái)到荻市進(jìn)行調(diào)查，卻不慎遭到了神秘人的槍擊，所幸無(wú)人受傷。因擔(dān)心明日香的安危，毛利小五郎迅速向明日香致電，正當(dāng)二人通話時(shí)，明日香卻遭到了神秘人的綁架。寶田先生告訴眾人犯人疑似是藤木律師，并猜測(cè)明日香被綁架的地點(diǎn)在指月公園。而柯南則在明日香掉落的手機(jī)中發(fā)現(xiàn)了其他線索，只身一人前往目的地搜尋明日香的下落。

利用步美找到的暗號(hào)解讀表，柯南本以為能順利解開暗號(hào)，不料卻遇到了瓶頸。正當(dāng)此時(shí)，若狹老師再次拜托少年偵探團(tuán)前往舊倉(cāng)庫(kù)尋找石灰。來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)的眾人發(fā)現(xiàn)倉(cāng)庫(kù)一片狼藉，在若狹老師不經(jīng)意的提示下，柯南終于解開了暗號(hào)的含義，并推測(cè)犯人將再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)。為了避免打草驚蛇，柯南設(shè)計(jì)誤導(dǎo)犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)，柯南能否順利將犯人一網(wǎng)打盡？

練習(xí)空手道的京極曾在幼時(shí)受到高見達(dá)人的指點(diǎn)，高見老師的教誨才成就了如今的京極，京極拜訪老師道館的時(shí)候園子拖著柯南也來(lái)參觀。高利貸催款的人來(lái)到了道場(chǎng)，得知老師要賣掉道場(chǎng)引退后京極非常反對(duì)，京極出去沒(méi)多久就聽到了玻璃破碎的聲音，一行人沖出去后發(fā)現(xiàn)道館內(nèi)寶貴的黑帶不見了。

不分晝夜騎著巨大摩托車四處游蕩的天城達(dá)也遇害，生前給周圍居民帶來(lái)不小困擾的他遭到了人們的冷漠對(duì)待，大家都很慶幸有人殺了他。應(yīng)當(dāng)擔(dān)任與天城達(dá)也溝通協(xié)商的居委會(huì)會(huì)長(zhǎng)番藤?gòu)┮凰涝诹俗约旱募抑校m然現(xiàn)場(chǎng)布置成了自殺的模樣，但柯南和小五郎還是看出了端倪，這一點(diǎn)被咖啡廳的老板金滿豐子證實(shí)，她提出昨晚番藤根本就不會(huì)與天城見面。