陶謙手下因為圖財害命而殺曹操之父，曹操（鮑國安飾）為報殺父之仇，領兵殺赴徐州陶謙。糜竺前往孔融處請求救兵，正在孔融處投靠的劉備（孫彥軍飾）、關羽（陸樹銘飾）、張飛（李靖飛飾）三人決定前往救助徐州。陶謙感激劉備的仁義，加之自己老邁多病，欲讓出徐州，但劉備只因大義而來相助，并非想吞并徐州，因而一讓再讓，并提出先退曹操之兵。此時曹操收到消息，呂布攻陷山東，曹操依郭嘉之計退兵山東。陶謙再讓徐州，劉備依然拒絕，暫居小沛。曹操大敗呂布，呂布欲投劉備。陶謙病重，三讓徐州與劉備，劉備最終領下徐州。

金庫的寶石一顆不剩全被盜走，博人等人解決的事件正是白夜團用來轉移注意力的佯攻，自稱義賊的白夜團在各個村子興風作浪，但卻從來沒有留下作案痕跡。佐良娜通過金庫前冰結的鮮花推斷對方是會使用冰盾的忍者，他們通過這點著手展開了調查，掌握到白夜團的行蹤的博人一行也看到了被白夜團幫助的村民，眼前的一切讓博人不知該如何來衡量善惡。

自稱宇智波信的敵人左臂里埋入了復數的寫輪眼，這讓鳴人和佐助聯想到了大蛇丸，為了救回小櫻他們決定前往大蛇丸的基地。在大蛇丸的基地里佐良娜看到了和爸爸合照的鷹小隊成員，她私下詢問水月關于香燐的事情，并稱香燐可能是自己的親生母親，多事的水月拿出香燐留下的臍帶樣本比對DNA，沒想到竟與佐良娜的DNA完全吻合。

四代水影矢倉曾經用恐懼支配著村子，而神樂是矢倉的孫子，他一直認為自己體內流淌著劊子手的血，為此他放棄了繼承忍刀七人眾的稱號只愿輔佐長十郎，和博人相識改變了這一切。神樂下定決心繼承雙刀鲆鰈，并立志將其用于和平。但干柿尸澄真的出現讓這一切有了變數，他利用神樂的心理陰影推動反叛。

孫堅死后，其子孫策（濮存昕飾）謀求大業，身居袁術帳下。孫策勝仗連連，居功至偉，但袁術生怕功高蓋主，對孫策異常冷落。孫策與遺臣程普、黃蓋商議后，決定用傳國玉璽跟袁術換得兵馬，進兵江東，力圖大業。在進兵途中，孫策遇到了結拜兄弟周瑜（洪宇宙飾），兩人決定合兵一處。孫策與周瑜商議先收攬江東才俊，然后攻陷劉繇。一翻大戰之后，孫策人才盡覽，立足江東，袁術悔之晚矣。