簱本家族的人聚在餐廳斷定兇手就是小武 ，就在長(zhǎng)女麻理子擔(dān)心去廁所遲遲未歸的兒子一郎時(shí)，游輪突然停電，隨之而來(lái)的是一郎的慘叫，在黑暗中他被兇手刺傷了腿，小五郎在電源室發(fā)現(xiàn)這是有人蓄意的斷電，他立刻命所有人留在餐廳，自己和柯南，小蘭尋找線索，迷霧漸漸撥開(kāi)，兇手真的是突然消失的小武嗎？

柯南、小蘭和小五郎碰帶了一個(gè)深情恍惚的少女，送去醫(yī)院檢查后，醫(yī)生說(shuō)少女暫時(shí)失去記憶，幾人從僅有的信息中找到了她所住的飯店，柯南不停的詢(xún)問(wèn)讓少女頭疼而跑出酒店，突然有一輛汽車(chē)迎面開(kāi)來(lái)，但少女靈敏被避開(kāi)，調(diào)查過(guò)程中柯南發(fā)現(xiàn)這名女子身手矯健總能避開(kāi)危險(xiǎn)，她到底是什么人？為什么總遭到襲擊？

麗花身上有被捆綁的痕跡，柯南在調(diào)查中扭開(kāi)水龍頭的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)水居然是從蓮蓬頭流出，確定了兇手之后，接下來(lái)就是找證據(jù)，柯南麻醉小五郎，借助小五郎的聲音讓三船、五條、六田、一枝脫下外套，更加確定了自己的推測(cè)，在黑暗的別墅中，柯南指出兇手，而兇手的殺人動(dòng)機(jī)則源于兩年前。

步美某日經(jīng)過(guò)傳說(shuō)中的鬼屋，而且還看到屋內(nèi)有鬼火！為了一探究竟柯南，步美，光彥還有元太一起出動(dòng)來(lái)到這個(gè)傳說(shuō)中的鬼屋。因?yàn)槲葜鞅粴⒑蠹依锏钠渌司屯蝗婚g不知去向，于是許多鬧鬼的傳說(shuō)就此傳開(kāi)。但在柯南和少年偵探團(tuán)的各位探查之后發(fā)現(xiàn)了鬼屋中真的有人居住著！在調(diào)查了屋子之后柯南終于發(fā)現(xiàn)背后真正的秘密。最終殺害房子主人的兇手也自首承認(rèn)罪行。

放學(xué)后，光彥一伙兒聚在一起研究寬波段接受器時(shí)，無(wú)意中接聽(tīng)到了一個(gè)綁架恐嚇電話，大家都很擔(dān)心這個(gè)被綁架的女孩性命，便決定根據(jù)這通電話找到女孩，柯南根據(jù)歹徒陸續(xù)打給女孩爸爸的電話，和伙伴們一步步找到了被害人和歹徒的位置，成功解救人質(zhì)。