少年偵探團的理科自由研究作業是拍攝鎮子的全景照片，為此阿笠博士帶他們來到云丸山露營，在山中小屋他們遇到了正在爭吵的四人，而三年前意外去世的元木是他們爭吵的焦點。爭吵過后岳美負氣離開睡在了懸崖底下，半夜的時候榮子等人為三年前因意外去世的元木默哀，正好醒來的柯南見證了這一幕，但在第二天元太卻發現山下的岳美小姐倒在了血泊中。

死者被殺時手里握著剪刀，尸體的傷口處還粘滿了蜂蜜，不僅如此，案發現場的水龍頭還一直開著，柯南和昴確定兇手就是零食店的仙波先生，但他們還一時半會兒找不到兇器。在詢問了保鏢后柯南有了一些線索，阿笠博士在院子里看到的成群螞蟻也為他們提供了幫助，兇手到底是運用了什么手法來作案的呢？

這天，下課了，米小圈看到平時活潑的劉凱竟然坐在自己的座位上折紙，他好奇過去慫恿劉凱一起來玩，劉凱傷心地說他家破產了，爸爸以前總是特別忙，現在賦閑在家好幾天了，并且很多天都沒有吃肉，現在他也只好折紙盒兼職做外快。看到劉凱那么難過，米小圈也忍不住心酸。晚上，米小圈看到家里餐桌上只有一只雞腿，母親在啃生蘿卜，父親在喝蔬菜汁，想到白天劉凱的遭遇，忽然也有種預感，難道他的爸媽也破產了！晚上，米小圈和劉凱通電話，將他家的伙食情況告訴了劉凱，小伙伴斷定他家真的破產了。為了幫助爸媽分擔，第二天上學，米小圈和小朋友商量怎么幫助爸媽度過經濟危機，他的小伙伴建議這世界一本萬利的方法就是用自己的腦子賺錢，他們決定可以用出租漫畫書的方式，這星期三個人忙壞了，終于賺了一百塊錢。有了人生第一桶金，米小圈和鐵頭興奮地憧憬著如果全校同學都來借他們的漫畫書會掙到更多，不久，鐵頭接到一份大單，有人要租全部的漫畫書，米小圈和鐵頭興奮了整整一上午，終于去到約定的時間，對了暗號，沒想到被班長李黎給抓了包。所有漫畫書也被班主任老師扣到了辦公室。晚上，米小圈回到家，看到爸媽依然把最好的食物推到他面前，媽媽繼續啃胡蘿卜，父親僅僅喝了一

警方確定了一起寶石搶劫案的嫌疑人，嫌疑人鷹取嚴男躲在一個倉庫里，不知為何柯南與小五郎也在場。警方突破倉庫門進入準備抓捕嫌疑人時，鷹取嚴男打開事先設下的陷阱，趁現場混亂之時綁架了柯南當做人質逃跑。柯南在犯人車上伺機逃跑，不料卻跑進死胡同里被抓。無奈之下柯南被帶到了一個荒廢的倉庫里，犯人鷹取嚴男究竟想讓柯南做些什么？

阿笠博士帶著少年偵探團去朋友家的別墅玩，眾人卻在別墅的院子里發現一名倒在血泊中的男子，經證實此人正是俗稱“佐羅”的連環搶劫縱火犯的同黨伊勢原祐二。為了解開謎團，柯南只身一人前往深山，目睹了佐羅意圖殺害伊勢的場面。想要解圍的柯南在和伊勢一起逃亡的過程中被逼上了臨海的懸崖，在佐羅的追殺中不慎墜落懸崖的二人命運將會如何？