警方分別對三位女當(dāng)事人進(jìn)行了詢問，并檢查了她們隨身攜帶的物品，而案發(fā)現(xiàn)場所發(fā)現(xiàn)的白色涼鞋成為了本案最大的疑點(diǎn)。在諸多線索的指引下，柯南和世良很快便推理出兇手的身份，但卻未能明白兇手的作案手段。最終在園子不經(jīng)意的提示下，柯南順利地將案發(fā)過程演繹給眾人，成功找出真兇。而兇手與死者之間，竟有這樣一段不為人知的往事……

柯南醒來后發(fā)現(xiàn)自己身在一個狹小黑暗的空間里，眼睛漸漸習(xí)慣后他才發(fā)現(xiàn)自己被困在了棺材里，能聽到風(fēng)聲這一點(diǎn)證明他還沒被埋起來，暈倒前的一幕幕也漸漸想了起來。毛利小五郎最近接到了一起案子，律師事務(wù)所保險柜被撬，存放在里面的遺囑不見了，這是過世的塘橋集團(tuán)會長的遺囑，這件事與柯南的遭遇是否有聯(lián)系呢？

柯南確信被警察盯上的千野并不是真正的犯人，而尸體的第一發(fā)現(xiàn)者福田先生和催促番藤與天城協(xié)商的江崎小姐都有殺人的機(jī)會，但在調(diào)查中柯南并沒有得到這方面的線索。案件的條理逐漸明確，犯人殺死天城和番藤的目的是為了陷害千野，想起千野偶爾擔(dān)任推理小說新人獎的審查后另一條線索出現(xiàn)了。

17年前日本將棋四冠王羽田浩司遇襲案讓柯南非常在意，和他同日遇害的還有同一酒店的美國資本家阿曼達(dá)，柯南和灰原推測這是組織所為，但羽田浩司遇害時的房間卻不像是組織的一貫風(fēng)格。地產(chǎn)公司社長被害時手里拿著阿笠博士發(fā)明的剪刀，目暮警官請阿笠博士來說明剪刀的用途看是否能為破案提供幫助，柯南注意到這次的案件卻與17年前羽田浩司遇害案非常相似。

柯南等人幫助舊書店店主裕次郎搬運(yùn)書籍，并在書店遇到了裕次郎的兒子一郎。一郎對于父親經(jīng)營舊書店的事感到很不滿，爭執(zhí)中眾人不歡而散。在光彥的帶領(lǐng)下，柯南等人來到了舊書店旁的公園，準(zhǔn)備觀看蒸汽機(jī)車發(fā)動的場面，并在等待的途中偶遇了一郎。正當(dāng)眾人與蒸汽機(jī)車合影完畢返回書店時，卻發(fā)現(xiàn)裕次郎被壓在了倒塌的書架下面……