周綺歷盡艱辛來到魏家，將家軒已""死""的消息說出，眾人皆悲傷萬分。 傷心的陳菁華不愿留周綺在家中，很不客氣地對周綺下了逐客令。周綺理解了她的心情，決定離開。 家寶覺得周綺是無辜的，追出相送，周綺表示自己想要去修女院，家寶便將她送到了修女院。 喬裝成男孩的金鳳跟隨家軒一起來到土匪山寨尋找周綺，兩人再次遇到了小土匪，三人結(jié)伴同行，卻遇到了日本兵，被抓到了勞工營。 家寶到修女院看望留在這里做了護士的周綺，看到周綺細心的照顧傷兵，感受到了周綺善良的心靈，明白了家軒為什么會對周綺如此癡狂地愛。 家軒三人被困在勞工營里受盡凌辱，決定伺機逃跑，結(jié)果行動失敗，被抓了回來。 在遭到日兵毒打的時候，金鳳露出了女兒身，結(jié)果遭到了日本兵的輪J。家軒目睹人間悲劇在眼前發(fā)生，卻無力制止，情緒受到極大波動。 日軍對上海發(fā)動空襲，張世保的斧頭幫被炸成平地，無奈下他霸占了季豪在租界里的房子，兩人關(guān)系就此決裂。

同學(xué)們撤往后山，卻沒想到日軍的飛機這次徑直飛向?qū)W校。畢云霄大喊讓同學(xué)們快跑，程嘉樹想起儀器還在實驗室，立刻跑了回去，畢云霄和林真跟在他身后。三人迅速把儀器收好，跑進學(xué)校的應(yīng)急防空洞躲避。丁小五的姑父是日本間諜，他混入西南聯(lián)大后，特地在實驗室的周圍放了鏡片，方便日軍鎖定實驗室進行轟炸。等轟炸次數(shù)減少，三人撤離防空洞，程嘉樹返回宿舍拿林華珺送給自己的洋蔥，但被困在宿舍里。宿舍被轟炸起了火，門被鎖塊扣住，文頡聽到程嘉樹的求救聲，但他竟見死不救。這次轟炸，有許許多多的學(xué)生受傷，雙喜詢問畢云霄，得知程嘉樹返回宿舍拿那盆洋蔥。另一個剛從學(xué)校跑出來的同學(xué)說，學(xué)校被炸，宿舍也都被炸爛了。雙喜和畢云霄立刻趕回學(xué)校宿舍，在千鈞一刻之際救出了程嘉樹。文頡在走之前，告訴程嘉樹說林華珺在南屏大劇院等他，因而他被救出后，往南屏大劇院的方向跑。林華珺在街上，親眼目睹一對夫妻為了保護孩子，死于日軍的轟炸之下，程嘉樹趕至，護著林華珺和那個孩子趴下。轟炸后，剩下一堆受傷的人在舔舐傷口，承受失去親人的痛苦。梅貽琦從鄭天挺口中得知有少部分學(xué)生受傷，書籍損毀千余件，實驗室全部被炸毀。他安排鄭天挺一些事宜后，大藥房的繆蘭英女士帶

啟華被炸后，鈴木即將被貶職回日本。秋玲堅持不肯和他回日本，兩人發(fā)生爭執(zhí)，推搡中，秋玲從樓梯上滾下，造成流產(chǎn)。憤怒地鈴木不顧秋玲的死活，踢打受傷的秋玲，將秋玲致死。趕來的曉明揮刀殺死鈴木替親人報了仇，而他自己也慘死在了聞訊趕到了日本兵手中。 日本即將戰(zhàn)敗退出中國的前夕，家寶和家軒雙雙返回了上海，他們此次回來的目的只有一個：就是將日本人在中國掠奪的一批重要文物截下，用它們來完成戰(zhàn)后中國的重建工作。 二人找到世保，希望借助他在上海龐大的勢力幫助，完成這次計劃。 即將和洋麗結(jié)婚的世保，考慮再三，卻定下了一條毒計，欲圖將魏家兄弟和負責(zé)文物安全的崗田全部除掉，獨吞文物，以便日后繼續(xù)稱霸上海灘。 家寶和家軒兄弟前去截取文物中了埋伏，家軒為了掩護家寶，壯烈犧牲。 世保來到教堂，將欲圖非禮在這里祈禱的周綺的崗田擊斃，一雪當初跪地求饒的恥辱。 世保和洋麗的婚禮上，張世保被人行刺身亡。 戰(zhàn)后的江邊，劫后余生的周綺和家寶相遇，兩人感慨萬分，周綺最終選擇離開留給她太多傷心的上海，靜靜離去。"

所有人都以為程嘉樹死了，林華珺在難過之際，收到了一枚自窗口投擲而入的戒指，她知道程嘉樹如今是安全的。在行動前一晚，郭鐵林告訴華珺新的行動方案。而華珺必須留下，并且需要按照原計劃在規(guī)定的地方等候。林華珺表示會全力配合，讓警備司的人相信那輛車上坐的是程嘉樹。一兒一昆明慘案的真相，迅速傳遍全國，重慶、成都、延安、遵義、上海等地集會游行，聲援昆明學(xué)生，各界人士也紛紛譴責(zé)國民黨反動派的暴行，在全國人民的壓力下，蔣介石讓關(guān)麟征自請?zhí)幏郑⒗钭邳S調(diào)離。聞一多帶領(lǐng)學(xué)生們向烈士的靈位鞠躬致敬，他們一起宣誓，告慰四位烈士的在天之靈。程嘉樹在報上看到悼詞，十分感傷，要是他也在昆明，好好地和聯(lián)大告別該多好。抗戰(zhàn)結(jié)束了，西南聯(lián)大即將要北歸，梅貽琦發(fā)表講話，抨擊“落后就要挨打”的強盜邏輯，讓同學(xué)們用知識，讓母親富強起來，讓中國永遠不受欺凌。梅貽琦代表聯(lián)大常委會宣布，從今日起，國立西南聯(lián)合大學(xué)正式結(jié)束。馮友蘭宣讀國立西南聯(lián)合大學(xué)紀念碑的碑文，將西南聯(lián)合大學(xué)短暫卻又不平凡的歷史娓娓道來，眾人聽完后紛紛鼓掌。雙喜、阿美、潤青和華珺四人一起在國立西南聯(lián)大的門口拍照，這是他們留在西南聯(lián)大的最后一天。阿美對未來的規(guī)劃是考取

文頡接到電話，得知GCD的聯(lián)絡(luò)點在青山鎮(zhèn)下田村，他當即就要出門，被阿美阻止。文頡用力推開她，致使阿美發(fā)生撞擊大出血。阿美拼力跑去找林華珺，告訴他們說文頡帶人去青山鎮(zhèn)下田村抓聯(lián)大地下黨員了。方悅?cè)萘⒓撮_聯(lián)大的車去報告這個緊急情況，程嘉樹和林華珺將出血的阿美送到醫(yī)院，醫(yī)生立即對阿美進行搶救。林華珺留在醫(yī)院，程嘉樹則往下田村趕。周宏章帶著文頡和手下來到附近，派人悄悄做掉放風(fēng)的老秦。程嘉樹騎自行車過去，方悅?cè)蓍_車先一步到達。周宏章他們正要動手，方悅?cè)蓍_車朝他們沖過去，邊開邊摁喇叭進行提醒。他們朝著方悅?cè)蓍_槍，她不幸中槍。聽到槍聲的郭鐵林和裴遠之立刻明白出事了，眾人緊急撤離。方悅?cè)菰谝庾R清醒時，直接把車撞向房屋，裴遠之他們在不遠處看到那是聯(lián)大的車，他想過去看看，但郭鐵林讓他帶著其他人撤離，由郭鐵林自己過去查看。冥冥之中，裴遠之有預(yù)感，開這輛車給他們示警的人是方悅?cè)荨５任念R他們闖入屋內(nèi)，這里已經(jīng)人去樓空。文頡看到死的人是方悅?cè)荩瑖樀猛溶洝榱藲瑴幺E，他們直接連人帶車燒毀。程嘉樹騎著自行車中途摔倒，他跌跌撞撞跑向著火點，郭鐵林直接攔住他。程嘉樹失控，說什么也要沖過去，郭鐵林只好將他打暈。另一邊，醫(yī)