綾乃在休息日應(yīng)邀來(lái)到了美冬家，誰(shuí)知在門口時(shí)卻聽(tīng)到了屋內(nèi)的爭(zhēng)吵聲以及美冬的慘叫，終于打開(kāi)門的綾乃只看到了美冬的尸體和房?jī)?nèi)凌亂的腳印。匆忙逃命的綾乃在路口撞上了柯南和毛利并帶他們來(lái)到了案發(fā)地，而當(dāng)柯南他們順著屋內(nèi)遺留的線索找到“兇手”田端時(shí)卻發(fā)現(xiàn)對(duì)方竟然已經(jīng)死亡。

一家房地產(chǎn)公司的黑心社長(zhǎng)東先生和他的助手河西找到了毛利小五郎，他們稱自己接到了殺人預(yù)告電話，而對(duì)方的目標(biāo)就是東先生。嫌疑人有三個(gè)，小五郎和柯南一一找他們確認(rèn)過(guò)，調(diào)查過(guò)程中柯南察覺(jué)到了一絲異常。三個(gè)嫌疑人被叫到了一起，柯南麻醉了小五郎后展開(kāi)了推理，但就在結(jié)果出來(lái)后眾人卻都露出了詭異的笑容。

夜晚園子心血來(lái)潮帶著小蘭和柯南來(lái)公園里觀賞銀河，不料卻在花壇里發(fā)現(xiàn)了一起行兇案。園子透過(guò)望遠(yuǎn)鏡看到了一雙女子的手，她手上的戒指正在被兇手摘下，園子過(guò)于震驚沒(méi)有看到兇手的長(zhǎng)相。之后園子大概確定了行兇案的方向，帶著小蘭和柯南組成女高中生偵探團(tuán)去破解這樁行兇案。

柯南所在的班里來(lái)了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫線，卻發(fā)現(xiàn)石灰已經(jīng)用完了。柯南告訴若狹老師舊倉(cāng)庫(kù)里可能有石灰，元太和光彥開(kāi)玩笑說(shuō)舊倉(cāng)庫(kù)有幽靈出沒(méi)，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團(tuán)一同前往舊倉(cāng)庫(kù)。在尋找石灰的過(guò)程中，柯南發(fā)現(xiàn)一扇通往地下的門，眾人合力打開(kāi)門后，卻驚人地發(fā)現(xiàn)了一具骸骨……

7年前杯戶街上發(fā)生了一起搶劫殺人案，案件當(dāng)時(shí)只有一個(gè)目擊證人，那就是5歲的小女孩友里未央奈。7年后小五郎帶著蘭和柯南一起來(lái)到鳩笛莊度假，友里未央奈正是鳩笛莊女主人的女兒。來(lái)度假的客人井出正也無(wú)意間談起了7年前很熱門的特?cái)z劇彗星假面超人比恩，這讓友里未央奈陷入了恐慌之中，因?yàn)楫?dāng)年那起搶劫殺人案的犯人戴的就是假面超人比恩的面具。