在東京的松陰神社，少年偵探團(tuán)及時(shí)救下了被男子襲擊的小早川公子小姐，為了尋找她爺爺藏起來(lái)的足以買(mǎi)下國(guó)家價(jià)值連城的寶藏，大伙一起前往她的老家津和野在中途的新山口車站，遇到了自稱是公子小姐的朋友川子茂先生，但柯南和灰原注意到這并非他的真名，到達(dá)之后，他們又發(fā)現(xiàn)了新的暗號(hào)，順著線索來(lái)到了萩市，沒(méi)想到襲擊公子小姐的人那些人將灰原、光彥和公子小姐帶走。

最近，都市里出現(xiàn)了一名專門(mén)襲擊長(zhǎng)發(fā)女子的榔頭男，警方根據(jù)目擊者的通報(bào)找到了榔頭男的住所并在周圍展開(kāi)了監(jiān)視，期間，有三個(gè)人陸續(xù)進(jìn)出過(guò)榔頭男的房間，他們分別是宅配快遞員、機(jī)車送貨員和披薩外送員，考慮到這可能是兇嫌所使用的調(diào)虎離山計(jì)，警方匆忙沖進(jìn)了他的房間，不想?yún)s發(fā)現(xiàn)一名疑似榔頭男的人倒在屋內(nèi)。

根據(jù)這個(gè)如此漏洞百出的犯案現(xiàn)場(chǎng)，柯南推斷前來(lái)拿走照片的人并不是黑暗組織，為查明真相，柯南讓店長(zhǎng)分別給三個(gè)有備份鑰匙的人打電話詢問(wèn)他們的行蹤，卻并未發(fā)現(xiàn)有何異樣，然而，一切都逃不過(guò)柯南敏銳的眼睛，他將凳子上汗?jié)n與這三個(gè)人是身形相聯(lián)系，斷定拿走照片的人就在他們之中并且這個(gè)人現(xiàn)在就在房間里。

小五郎載柯南和小蘭去泡溫泉的時(shí)候，目暮警官突然打來(lái)電話，說(shuō)他們租來(lái)的這輛車子上被人安裝的炸彈而且時(shí)速必須保持在20公里以上，否則就會(huì)引起爆炸，面對(duì)這種突發(fā)狀況，小五郎只能繼續(xù)開(kāi)車等待警察前來(lái)救援，但是即使打破玻璃救走小蘭和柯南，卻依舊無(wú)法保證小五郎的安全，如何讓車子在保持時(shí)速的情況下停止？犯人到底與小五郎又有何恩怨？

康司、義郎以及綾華這三位死者有一個(gè)共同點(diǎn)，那就是他們?cè)c阿景和繁次一起挖過(guò)武田信玄的秘密金山。之后，柯南和服部去龍尾家查看武田信玄的盔甲時(shí)碰巧看到了他常用的軍事戰(zhàn)略“風(fēng)林火山”而這正好與康司、義郎和綾華的死亡狀況相符合，那么，由此可以推斷兇手出接下來(lái)可能要施以目標(biāo)以火刑，就在這時(shí)，和葉打來(lái)電話說(shuō)有人倒大火之中，而這個(gè)人就是繁次。