小蘭的同學(xué)直子被綁架，當(dāng)歹徒發(fā)現(xiàn)有警察時(shí)，便放棄交易開車沖進(jìn)海里，直子再次下落不明，直子父親的秘書花井很是擔(dān)心。某日，小五郎突然接到不要在調(diào)查此事的要求，柯南察覺事有蹊蹺，暗暗潛入直子家后聽到了花井和直子爸爸的談話，原來直子的爸爸再次接到歹徒電話，但他卻不愿花五億保女兒的性命，這讓花井很生氣，柯南躲在后備箱里，跟著他們來到交易場(chǎng)所，見到了所謂的「歹徒」。

委托人為表示感謝，招待小五郎三人溫泉旅行，他們?cè)诖畛藴娇h的列車上，遇到了兩名爭(zhēng)吵的醫(yī)生佐藤、伊達(dá)，期間伊達(dá)曾生氣離開。換乘休息的途中，警察在與湯之山線列車路線基本相同的花之街線列車上發(fā)現(xiàn)尸體，柯南洞察到伊達(dá)神情怪異有犯罪嫌疑，可他是怎么樣在兩趟不一樣的列車上游走殺人的？

因洋子推薦慈善高爾夫大會(huì)，小五郎抓緊練習(xí)，而在高爾夫球場(chǎng)還有其他一行人打球，分別是某開發(fā)部的經(jīng)理橘、課長(zhǎng)安井、主任大久保和社員南，橘和安井的技術(shù)非常好，安井將球打完后，休息了一會(huì)兒便離開了，這時(shí)，球場(chǎng)突然發(fā)生爆炸，橘死亡，除離開的安井外，其他兩人均受傷，小五郎順利的推理出兇手就是安井，但柯南確認(rèn)為真兇另有其人……

暮目警官趕來寺院展開調(diào)查，就在大家一籌莫展準(zhǔn)備離開時(shí)，獨(dú)自調(diào)查的柯南從被強(qiáng)大力量打破的墻壁、切口變形的走廊木板、被丟在樹林里的角窗碎片和膠帶中洞察到了兇手的犯案手法，以及兇手就在四個(gè)修行僧當(dāng)中，他用阿笠博士給他的紐扣擴(kuò)音器道出真相，而兩年前以同樣手法殺死修行僧忠念的居然另有其人。

某天一個(gè)自稱是新一女朋友的量子前往毛利偵探事務(wù)所，此舉引起了小蘭極大的反感。其實(shí)量子被拜托看護(hù)著名足球運(yùn)動(dòng)員赤木英雄的弟弟赤木守，而小守竟遭綁架！迫于綁匪的壓力量子不敢驚動(dòng)警察才出此下策。在小蘭拜訪量子的時(shí)候柯南發(fā)覺了量子的難言之隱以新一的身份打來了詢問電話。在柯南的推理幫助下終于找到被綁架的小守而英雄也在得知弟弟被找到后完美的贏得了比賽。