柯南離開時雖交代元太他們把追蹤眼鏡交給警方，但想要立功的偵探團卻私自行動，并利用眼鏡找到柯南的位置，正要打電話報警的時候被歹徒發(fā)現(xiàn)。眼看就能將TWO-MIX解救，柯南卻因元太等人的綁架，再度落入敵人手中，他戳穿歹徒想要練習帶的目的后，歹徒惱羞成怒點燃屋內(nèi)的汽油，柯南等人能否成功逃脫？

城中美術(shù)館冒出中世紀盔甲會自己走路的傳聞，引起了小蘭濃厚的興趣打算一探究竟，沒想到卻意外地發(fā)現(xiàn)美術(shù)館在一周后即將關(guān)閉。而購買美術(shù)館的購買者真中計劃將這里改造成酒店。小蘭一行在參觀地獄館的過程中發(fā)現(xiàn)真中被釘在墻上，而在回放錄像的時候發(fā)現(xiàn)竟然是展覽的盔甲將真中殺害！但在回放了錄影帶和勘察現(xiàn)場之后柯南發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法并找出了真兇。

柯南和伙伴們?nèi)ッ佬g(shù)館時撿到了一張畫有奇怪符號的紙，大家自行成立少年偵探團去調(diào)查這些暗號，按照符號的指示先到達東京塔，在周圍展開偵查卻一無所獲，休息的時候步美的新發(fā)現(xiàn)為柯南找到破解暗號的出口，大家一路尋找從東京鐵塔到南部水族館的標記，然而，事情并非那樣順利，柯南能破解暗號嗎？暗中跟蹤少年偵探團的黑衣人又是誰？

這個從天而降死亡的人是江源，但從領(lǐng)結(jié)和皮帶等細節(jié)可以看出暗夜公爵并不是江源，警察去江源房間搜查時，發(fā)現(xiàn)房門居然上有防盜鎖，兇手把江源推下后是怎么逃脫的？在警察對其他人偵訊時，暗夜公爵將看守江源尸體的空手道高手打昏，還出現(xiàn)在了柯南、小蘭和佐山面前，并完全躲開了小蘭攻擊，難道說兇手就是……

小蘭、園子和柯南三人滑雪時，意外的碰到小蘭的小學老師米原等人，并在他們的邀請下住進了滑雪別墅里，當晚，園子和米原被人襲擊，之后還發(fā)現(xiàn)了遲到的杉山被人勒死的尸體，他們?nèi)齻€人手上分別寫著「美」「奈」「子」三個字，看到這些字下田回到自己房間躲起來，柯南和阿笠博士聯(lián)系后得知三年前杯戶小學發(fā)生過自殺案件，當時自殺的學生就叫望月美奈子。