在宅急便送圣誕蛋糕到阿笠博士家前，柯南等人在公園踢球消化腸胃，途中為了追把保羅咖啡廳當(dāng)做根據(jù)地的貓咪，他們不小心被關(guān)進(jìn)了宅急便的配送冷藏車(chē)內(nèi)。想辦法離開(kāi)的他們看到了貨柜里的尸體，打算向外界求救時(shí)手機(jī)又恰好沒(méi)電，拿出手邊所有東西的他們準(zhǔn)備想辦法向外界求助。

因?yàn)樾√m不在家，柯南和小五郎決定去杯戶(hù)町的一家拉面館吃飯，雖然這家飯館標(biāo)榜的是美味的要死的拉面，但店面卻相當(dāng)破舊，隨后，想要在這條商業(yè)街炒地皮的奸商西津也來(lái)到這里并與老板小倉(cāng)、店員彩代以及隔壁理發(fā)店長(zhǎng)谷中發(fā)生了激烈爭(zhēng)吵，使這里的氣氛變得一團(tuán)糟，唯一值得安慰的是端出的拉面果真是絕頂美味，然而，西津卻在吃完拉面后倒地身亡，是意外還是謀殺？

以大阪發(fā)生的事件為契機(jī)，平次等人特地來(lái)到東京搜查，事件現(xiàn)場(chǎng)是一所公寓的房間，經(jīng)過(guò)柯南和平次的調(diào)查后判定這是一起自殺案件，利落解決案件的柯南等人準(zhǔn)備乘坐電梯回去時(shí)又發(fā)生了命案。乍看之下發(fā)生在眼前的是自殺案件，但柯南和平次發(fā)現(xiàn)了很多疑點(diǎn)，根據(jù)高木警官打聽(tīng)的結(jié)果，柯南等人鎖定了三名嫌疑人。

正在進(jìn)行的推理游戲卻變成了真正的殺人事件，在列車(chē)到達(dá)名古屋前柯南他們要在乘客中揪出真正的兇手來(lái)，在他們四處尋找線(xiàn)索的時(shí)候灰原卻忍受著內(nèi)心的煎熬。內(nèi)心忐忑不安的灰原正在受到組織的威脅，組織的黑影已經(jīng)更近一步接近灰原，她絕對(duì)不能以這種摸樣被人殺害。

現(xiàn)場(chǎng)的鄰居是前男友（后篇）