小五郎曾抓捕過(guò)的殺人犯富樫文孝，在假釋的第二天再次因?yàn)闅⑷吮蛔ミM(jìn)了警局，小五郎深信決定重現(xiàn)做人的他不會(huì)再做出這種殺人的事情，便在偵訊室里勸導(dǎo)他說(shuō)出真相，可是富樫卻一直保持沉默。另一方面，柯南和高木警官再次來(lái)到案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行調(diào)查，根據(jù)目擊者的證詞以及附近便利店的監(jiān)視影像，柯南發(fā)現(xiàn)事情的真相并非那么簡(jiǎn)單，因?yàn)榘赴l(fā)現(xiàn)場(chǎng)除了富樫還有另外一個(gè)人。

大家二次來(lái)到倉(cāng)庫(kù)后發(fā)現(xiàn)了在門(mén)上方供奉著的神壇，而讓柯南更為好奇的是神壇對(duì)面的大算盤(pán)，這很可能是啟動(dòng)機(jī)關(guān)的鑰匙，仔細(xì)觀(guān)察倉(cāng)庫(kù)之后，柯南發(fā)現(xiàn)了其中的蹊蹺，他叫來(lái)警察與他一起根據(jù)灰塵的多少撥動(dòng)算珠，果不其然，天花板漸漸向下移動(dòng)，警察不僅在這里找到了被盜的寶物還抓住了偷盜者，案件結(jié)束后，柯南揪出了那個(gè)一直暗中幫助元太他們的“軍師”，而這個(gè)人正是……

警方在那海的家中并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)跟蹤狂出現(xiàn)的痕跡 ，可是兇手如果是那海，她又是如何犯案的呢？因?yàn)樗牟辉趫?chǎng)證明人正是白鳥(niǎo)警官。白鳥(niǎo)警官打電話(huà)讓高木在電影院調(diào)查，并讓他買(mǎi)飲料證實(shí)自己的想法，雖然這個(gè)結(jié)果讓白鳥(niǎo)警官難以承受，但是為了揭露真相，他揪出了兇手并破解了她的犯案手法，待一切塵埃落定，白鳥(niǎo)警官陷入了消沉的漩渦，就在這時(shí)出現(xiàn)了一個(gè)人……

阿笠博士帶柯南他們一起去吃回轉(zhuǎn)壽司的時(shí)候，遇見(jiàn)了一個(gè)讓人反感的客人我妻，他不僅挖苦元太和周遭的客人，而且還與這里的店長(zhǎng)發(fā)生爭(zhēng)執(zhí)，當(dāng)柯南他們準(zhǔn)備離開(kāi)這種不愉快的氛圍時(shí)，我妻突然十分痛苦的倒地不起，柯南立刻判斷出他是被人毒殺，有三個(gè)曾與死者有過(guò)節(jié)的人成為了首要懷疑對(duì)象，然而警察并未從他們身上到隱藏的毒藥，兇手到底是誰(shuí)？他又是如何讓我妻拿到沾有毒藥的盤(pán)子？

警方在將這三個(gè)嫌疑人分開(kāi)偵訊之后，又在死者的包里發(fā)現(xiàn)了一把手槍和強(qiáng)盜集團(tuán)百鬼夜行留下的字條，并從小島權(quán)作的秘書(shū)那里得知，他舉辦此次活動(dòng)是為了尋找殺死自己愛(ài)犬的同叫小島的強(qiáng)盜頭目，于是柯南利用與死者相同的方法找出兇手，雖然證據(jù)被銷(xiāo)毀，但他巧施妙計(jì)讓兇手自己主動(dòng)承認(rèn)了罪行。