紀曉嵐探望戴沾。對證之下，兩人明白是和珅從中搗鬼使兩人頻生誤會。紀曉嵐表示如玉處境危險。為救如玉戴沾只得說出真相。得知如玉的真實身份，紀曉嵐驚訝萬分。如玉到獄中懇求戴沾與自己遠走高飛，戴沾卻表示要一心潛修《四庫全書》，不愿因為兒女情長而辜負顏驥厚望。得知乾隆早已知道自己的身份，如玉表示自己也早已忘記仇恨。紀曉嵐帶太后看戲，太后驚訝地發現公主為小月扮演，而駙馬正是如玉扮演。戲中駙馬原為女扮男裝，被發現后要處以死刑，太后深為同情女駙馬，令紀曉嵐修改劇本，恕女駙馬無罪。

為避免和珅從中舞弊，紀曉嵐自薦調查此事。紀曉嵐推薦不畏權勢的海升進行調查。和珅讓劉三盡快將煤窯脫手，劉三似有難言之隱。小月假扮皇室之人，與海升進山察探，表示要買下煤窯并約劉三在酒樓詳談。劉三得知后暗自慶幸，迫不及待地前去和海升商談買賣煤窯之事，被早已等候于此的紀曉嵐捉拿歸案。和珅表示自己查出劉三是開窯之人，并要求紀曉嵐從嚴查處，以示自己秉公執法。眾人規勸海升看在和珅的面上放過劉三，以給自己留后路，海升堅持要秉公處理，和珅擔心劉三供出真正的幕后主使而連累自己，于是命劉三服毒自盡。海升欲繼續調查，卻得知劉三已死并被家人拉回老家埋葬。

紀曉嵐受和與欽差福康安陷害，被罷官免職。他巧施計謀，以須臾不離口的煙袋點燃路邊一串鞭炮，幫助小月、莫愁在混亂之中及時逃脫官兵的羈押。小月為避追殺，東躲西藏，不期而同曾自稱“許仙”的皇上，皇上的龍顏自然使本欲趕盡殺絕的福康安望而卻步，不明底細的小月卻在慌亂中忽略了其中的隱情，還自認為是福星高照。 云州知府吳大人受和指使，對紀曉嵐落井下石，將其書籍用具等毀于雨中，和則乘人之危故做好人，想利用紀的聰明才智，解開皇上關于身世的疑團，以便邀功請賞。紀曉嵐看穿了他的陰險虛偽，毫不客氣地反唇相譏。 皇上表面上解除了紀曉嵐的官職，實際上是要其以一介布衣之身份，迅速勘查云州一帶官員貪污賑災糧款、中飽私囊的大案，不致打草驚蛇，紀曉嵐欣然接受。 莫愁、小月等以舞獅子做掩護，將紀曉嵐、和與“許仙”劫為人質，既身陷囹圄，不免苦中作樂，三個人嬉笑怒罵，皆成文章，紀曉嵐更是不失時機，利用各種機會，使和丑態百出。

小芳自首，表示自己殺死了姐姐。紀曉嵐責怪小月擅自將海升之事告訴小芳，將事態嚴重化。貴寧、賈三光天化日要劫走香兒，香兒在廝打中不慎撞死。當聽說逃走的打手是長了四指的任五，紀曉嵐豁然開朗。得知小芳就是昔日選秀時大鬧順貞門的人，乾隆派紀曉嵐和綿恩重審小芳。小芳公堂之上自欖罪責，紀曉嵐讓海升與其對質，海升與小芳爭相認罪，紀曉嵐與和珅陪乾隆去戒臺寺。方丈受紀曉嵐委托。將李二原本為一村夫野漢，卻因得到官宦輔佐而搖身一變成為活佛的真相告知乾隆。紀曉嵐發現任五藏匿在此。在豆腐坊無意中得知黃豆受潮發芽的力量足以頂動石頭而得出佛像破土而出是因為土中埋有黃豆的結論后，紀曉嵐找到綿恩，讓其派兵捉拿李二以及任五。

乾隆拜祭顏驥，碰到女扮男裝的如玉。乾隆對如玉的見解產生興趣。這時殺手趕到，乾隆挺身相救，并帶如玉從樓上一躍而下逃脫了追殺。紀曉嵐想到往年和珅都請自己給太后寫祝壽賦，于是想借此來向和珅交換煙桿。誰知和珅拿出戴沾的祝壽賦來賣弄，紀曉嵐仔細看過后指出賦中暗藏對太后不敬之辭，和珅氣急敗壞。御醫為如玉療傷，卻發現如玉實為女兒身。得知紀曉嵐將賦中暗語告訴和珅，戴沾痛斥紀曉嵐。紀曉嵐苦口婆心規勸戴沾不要因一時沖動而葬送終生，兩人盡釋前嫌。乾隆下旨除去紀曉嵐《四庫全書》總纂官的職務，和珅幸災樂禍。如玉醒來得知乾隆身份大驚。乾隆佯裝不知如玉為女兒身，邀其共眠，如玉百般推辭。乾隆裝睡，如玉想到乾隆賜死全家，欲殺乾隆報仇，但想到自己為乾隆所救又不忍下手，痛苦之時想一死了之，被乾隆攔下。乾隆心下斷定如玉與顏驥有關。和珅指使同為編纂官的馮大人到獄中探望戴沾，馮慌稱要把戴沾的手稿編纂成冊，卻暗中將手稿交給了和珅，以換取自己落在和珅手中的罪證。乾隆帶如玉前往四庫館。如玉盡顯才學，被乾隆指派到四庫館修書。