打算盜取鈴木財(cái)閥家的黑珍珠BLACK STAR的怪盜基德，想起了以前關(guān)于鐘臺(tái)的一個(gè)事件，那是工藤新一和怪盜基德的第一次交手。另一方面，小五郎的事務(wù)所里收到一封附有支票的不明發(fā)信人的信函，并且在其上方還有一行奇怪的話語。

小五郎詢問阿稔有關(guān)郵票的事情卻得到郵票已經(jīng)不見了的回答，柯南也明白了小蘭看到的拄拐杖的老人的影子和埝被古琴毆打的真相。而柯南也指出春菜收到的音樂盒其實(shí)是秋悟托付給他人送出的。鬧鬼的屋子的真實(shí)原因其實(shí)是有人背后操作。而秋悟先生的音樂盒其實(shí)也只是一般的旅游紀(jì)念品而已，真正貴重的是隱藏在音樂盒里暗語所指示出的郵票。

柯南在從大阪回來的新干線中遇上了佐藤警官、高木警官。兩人正在押送毒品的秘密販賣者小倉。途中車內(nèi)發(fā)現(xiàn)可疑的炸彈包裹。就在佐藤前去查看之時(shí)留下高木警官的時(shí)候，犯人小倉要求去廁所，卻在廁所中用刀刺自己的腹部身亡。而在調(diào)查的過程中佐藤發(fā)現(xiàn)小倉血跡的疑點(diǎn)，并推斷出這是他殺時(shí)間而非自殺。

柯南和少年偵探團(tuán)幾天來一直覺得元太的舉止怪怪的，便追問元太，元太說他因?yàn)槟繐袅诉B續(xù)搶劫案的罪犯而正被追殺，這時(shí)從商場(chǎng)頂樓有鐵材向元太落下來讓原本以為只是元太想多了的柯南眾人也認(rèn)真起來了。元太聲稱見到連續(xù)強(qiáng)盜犯卻忘記在哪里看到的。在不斷的回憶前幾天的事情之后少年偵探團(tuán)的各位終于找到元太看到盜賊犯。

金澤氏由于被迷樣的狙擊者所威脅，委托小五郎調(diào)查。小五郎等人到了建筑師金澤氏的別墅。大家在巴比0時(shí)突然聽到槍聲，循聲去看時(shí)金澤氏已經(jīng)被殺害。毛利和警官發(fā)現(xiàn)了兇手殺人的機(jī)關(guān)推測(cè)犯人可能是外部人員但在柯南的調(diào)查下發(fā)現(xiàn)了兇手就是在島上的內(nèi)部人員。在罪證面前兇手最終承認(rèn)了罪行同時(shí)道出了因?yàn)榻饾赏当I自己設(shè)計(jì)而最終走上不歸路的事情。