柯南、步美等人從博士家里找到了一封四十年前來自博士初戀情人的信，信上除了說每十年在回憶的地點(diǎn)見面之外，還留下了一串像是暗示地點(diǎn)的數(shù)字，而今天剛好是四十年后的相約之日。經(jīng)過推理，他們一行人來到動物園，將信上的數(shù)字與動物入園的順序相結(jié)合，他們找到了飛鼠館，而正巧在他們的面前站著一位女性，她會是阿笠博士的初戀嗎？

小蘭、園子和柯南在打掃工藤家的房子時(shí)，門鈴?fù)蝗豁懫穑@個人正是出演女高中生偵探小雪的上戶彩，她急匆匆跑來是想要拜托新一找一位關(guān)系要好但如今不知去向的老奶奶，柯南在不暴露身份的情況下詳細(xì)詢問了奶奶離家出走時(shí)的情況，這時(shí)，園子說她知道老奶奶的所在，于是，一行人來到了社樂紀(jì)念館，遺憾的是柯南等人趕到時(shí)，老奶奶已再次離去，他們能找到老奶奶嗎？

柯南、步美等人在阿笠博士的帶領(lǐng)下，來到假面超人的拍攝現(xiàn)場，不巧正好碰上攝制組休息，在這期間不時(shí)能聽到陣陣的爭吵聲，劇組工作人員深町堅(jiān)決反對特效演員力石表演危險(xiǎn)動作，可是力石卻倔強(qiáng)的想要證實(shí)自己的實(shí)力，結(jié)果在表演中發(fā)生了意外，他的車子沖破柵欄從樓頂摔了下來，力石當(dāng)場死亡，當(dāng)所有人都為這場意外感到惋惜時(shí)，柯南卻看出了這是巧妙布局的殺人事件。

園子拉著小蘭和柯南去蛋糕博物館吃半價(jià)蛋糕，在這里每個師傅都有自己的廚房，參加比賽百戰(zhàn)百勝的前田、蛋糕王子藤野以及糖果魔術(shù)師森本都忙著為客人準(zhǔn)備甜點(diǎn)，期間，柯南還在藤野那里嘗試了做木頭蛋糕，就在藤野修飾好蛋糕拿給柯南吃的時(shí)候，店里卻發(fā)生了兇案，死者是蛋糕店長橋垣，而嫌疑最大的就是這三個蛋糕師傅，但警方卻苦于找不到兇器，隨后柯南對每個人的廚房進(jìn)行調(diào)查卻發(fā)現(xiàn)……

柯南在舊大社車站找到了可以證明江角案發(fā)時(shí)不在場的目擊證人，幫江角洗清嫌疑之后，福間也不在隱瞞而說出了事情的真相，其實(shí)在他到達(dá)現(xiàn)場的時(shí)候，鱷淵已經(jīng)死亡，在尸體身邊他發(fā)現(xiàn)了江角的項(xiàng)鏈，于是，就出現(xiàn)了兩人互相包庇的戲碼。既然鱷淵并非這對情侶所殺，那么兇手就在藤江和石飛之間，即使他們兩人都有不在場證明，真相也永遠(yuǎn)只有一個！