兇手看似打破窗戶逃了出去，但柯南和服部發(fā)現(xiàn)兇手就在屋內(nèi)，并且否定了兇手是老板的猜測(cè)，而剛才的停電也是人為的。期間，服部一直很在意柯南的種種反應(yīng)，對(duì)柯南產(chǎn)生了懷疑。事件漸漸明晰，服部和柯南知曉了兇手是誰(shuí)以及他殺死老板和綾子的手法。為了保護(hù)自己是工藤的秘密，柯南將服部麻醉說(shuō)出真相，可讓他沒(méi)想到的是，就是這個(gè)舉動(dòng)讓服部肯定了柯南就是工藤。

柯南和小蘭在參加天下第一夜祭時(shí)碰到了作家世井，他讓小蘭幫忙拍了幾張照片，這時(shí)，橫溝警官找到世井說(shuō)他的朋友今竹被殺，大家一起趕往犯罪現(xiàn)場(chǎng)，期間，世井用自己的文稿代替今竹的交給了《文藝時(shí)代》的記者，種種跡象表明世井就是兇手，可讓人棘手的是此人有不在場(chǎng)證明——相機(jī)里那些照片，仔細(xì)推敲后柯南發(fā)現(xiàn)了其中的破綻。

柯南在朋友們?nèi)D書(shū)館做讀書(shū)報(bào)告時(shí)，警察突然來(lái)詢問(wèn)圖書(shū)館職員玉田失蹤一事，館長(zhǎng)津川表示自己也不清楚，警察做了簡(jiǎn)單的搜尋后離開(kāi)。但少年偵探團(tuán)留到夜晚做深入調(diào)查，期間館長(zhǎng)曾鬼鬼祟祟的來(lái)過(guò)一次，等他離開(kāi)后，大家發(fā)現(xiàn)館長(zhǎng)在利用圖書(shū)館進(jìn)行販毒交易，當(dāng)他們找到被館長(zhǎng)殺害的玉田的尸體時(shí)，沒(méi)想到館長(zhǎng)也發(fā)現(xiàn)了他們，少年偵探團(tuán)能否順利脫險(xiǎn)？

小五郎帶小蘭和柯南看上山看櫻花時(shí)，因?yàn)槊月泛捅ケ焕г谏缴希@時(shí)又下起了雨，他們找到了一家寺院投宿，這里除了主持以外還有四個(gè)修行僧寬念、屯念、木念、秀念，在交談中，柯南等人模糊的知道了下雨天霧天狗殺人的傳說(shuō)。第二天，寬念在修行的房間發(fā)現(xiàn)了主持被吊在房梁上的尸體，而同樣的事情曾在兩年前也發(fā)生過(guò)。

少年偵探團(tuán)在海灘度假的時(shí)候，偶然認(rèn)識(shí)了春日財(cái)團(tuán)的大少爺和他的女朋友小忍。元太玩球時(shí)撿到了小忍發(fā)出的SOS求救漂流瓶，順著漂流瓶的方向，他們?cè)谝粋€(gè)洞窟找到小忍，原來(lái)這都是春日的安排，眼看海水滿潮，無(wú)法原路返回，大家在柯南的指揮下順利從洞穴另一邊逃出，看到小忍還活著，春日露出丑惡嘴臉以步美為人質(zhì)，關(guān)鍵時(shí)候小蘭趕來(lái)，將春日制服。