金澤氏由于被迷樣的狙擊者所威脅，委托小五郎調(diào)查。小五郎等人到了建筑師金澤氏的別墅。大家在巴比0時(shí)突然聽(tīng)到槍聲，循聲去看時(shí)金澤氏已經(jīng)被殺害。毛利和警官發(fā)現(xiàn)了兇手殺人的機(jī)關(guān)推測(cè)犯人可能是外部人員但在柯南的調(diào)查下發(fā)現(xiàn)了兇手就是在島上的內(nèi)部人員。在罪證面前兇手最終承認(rèn)了罪行同時(shí)道出了因?yàn)榻饾赏当I自己設(shè)計(jì)而最終走上不歸路的事情。

柯南本想找坐在旁邊的灰原商量，可是灰原依舊渾身發(fā)抖，并在茱蒂老師詢(xún)問(wèn)灰原身份時(shí)，對(duì)柯南發(fā)出暗示，柯南突然意識(shí)到可能有黑衣組織的人在車(chē)上，然而當(dāng)務(wù)之急是找出歹徒的同伙，當(dāng)公車(chē)駛?cè)胨淼罆r(shí)，歹徒讓咳嗽的乘客和新出老師換上他們的衣服并準(zhǔn)備帶走一名人質(zhì)以方便逃脫，所幸柯南看穿了他們的計(jì)劃，他指揮少年偵探隊(duì)做好準(zhǔn)備，在公車(chē)出隧道的一瞬間采取行動(dòng)……

看著奄奄一息的柯南，步美建議大家自己想辦法，三人按照石頭上的文字推斷出了出口方位又利用蝙蝠逃出了洞穴，歹徒也遭到逮捕。緊接著柯南被立刻送到醫(yī)院進(jìn)行治療，又在小蘭碰巧知道血型的情況下給他輸了血，小蘭最近的奇怪反應(yīng)讓柯南意識(shí)到自己的身份或許已經(jīng)在小蘭面前暴露，就在他打算向小蘭坦白時(shí)，灰原拿槍對(duì)準(zhǔn)柯南。

就在柯南和服部調(diào)查時(shí)，小蘭與和葉又親眼目睹了一起命案的發(fā)生，死者是旅行團(tuán)中的片桐，服部剛想要仔細(xì)調(diào)查，就被自己的老爸教訓(xùn)一番，可這反而激起了服部想要調(diào)查真相的欲望，柯南和服部根據(jù)手頭的線(xiàn)索和嫌疑人的供詞，推斷出了兇手，于是兩人暗中尾隨糟屋到一個(gè)破舊的工廠(chǎng)，然而螳螂捕蟬黃雀在后，柯南被不明人士挾持，這些人到底是誰(shuí)？服部能順利找到兇手嗎？

晚到的杰拉爾·天馬被劍殺死，和天馬有過(guò)爭(zhēng)吵的加那善成為了頭號(hào)嫌疑人。柯南則在勘察現(xiàn)場(chǎng)的時(shí)候發(fā)現(xiàn)窗臺(tái)上不自然的痕跡，而鋼琴上奇怪的東西也吸引了柯南的注意，最終柯南揭穿了像謎一樣的人物的真面目同時(shí)也解開(kāi)了殺害天馬的兇手所用的犯罪手法。在鐵證面前兇手最終承認(rèn)了自己的罪行并說(shuō)出了殺人動(dòng)機(jī)。