一直被大家遺忘在家中的狗引起了柯南與平次的注意，二人很快就洞察了這一系列殺人事件的作案手段。平次委托村長告訴眾人他已經(jīng)得知了鵺的真面目，并在庭院內(nèi)為眾人重新演示了一遍案發(fā)當(dāng)日的情形。在二人的推理下真相終于浮出水面，兇手成功被警方抓獲。當(dāng)案件塵埃落定后，平次終于鼓起勇氣準(zhǔn)備向和葉告白……

柯南和平次傳來歷史學(xué)家的死訊，眾人陷入恐慌，并認(rèn)為是怪物鵺在作怪。平次吩咐大家各自回房不要出門，考古學(xué)家主動(dòng)要求與小蘭交換房間。眾人回房后，柯南與平次在院子里和村長詢問細(xì)節(jié)，院子卻突然再次著火，與此同時(shí)樓上的考古學(xué)家似被不明物體擊中，慘叫一聲后倒在房內(nèi)，待柯南等人趕到時(shí)已經(jīng)喪命。經(jīng)過一番調(diào)查和推理，柯南和平次似乎有些眉目，而那只被大家遺忘在家中的狗突然引起了二人的注意。

千葉警官在警局四處詢問有關(guān)“不明飛行物”的線索，卻毫無所獲，這天他回到家，收到了聲稱是自己宇宙第一大粉絲的人寄來的神秘郵件。在另一邊，名為和田陽奈的女高中生來到毛利事務(wù)所，委托小五郎調(diào)查杯戶公園“UFO”一事。杯戶公園隔壁的杯戶高中發(fā)生殺人案件，這兩者是否有聯(lián)系？

警方確定了一起寶石搶劫案的嫌疑人，嫌疑人鷹取嚴(yán)男躲在一個(gè)倉庫里，不知為何柯南與小五郎也在場。警方突破倉庫門進(jìn)入準(zhǔn)備抓捕嫌疑人時(shí)，鷹取嚴(yán)男打開事先設(shè)下的陷阱，趁現(xiàn)場混亂之時(shí)綁架了柯南當(dāng)做人質(zhì)逃跑。柯南在犯人車上伺機(jī)逃跑，不料卻跑進(jìn)死胡同里被抓。無奈之下柯南被帶到了一個(gè)荒廢的倉庫里，犯人鷹取嚴(yán)男究竟想讓柯南做些什么？

日賣體育記者加賀爪弘和橋爪明曾在一年前報(bào)道過一篇關(guān)于大企業(yè)老板角山制作所的山角雄三社長去世引發(fā)的遺囑失蹤事件，這兩位記者當(dāng)時(shí)不斷煽風(fēng)點(diǎn)火，將自己挖到的爭奪遺產(chǎn)的丑聞都刊登在雜志上害的親屬爭執(zhí)不斷最后甚至引發(fā)了殺人未遂案。柯南白天在餐館遇到了這兩名關(guān)系很差的記者，沒想到就在當(dāng)晚，加賀爪弘竟然被發(fā)現(xiàn)在河邊遇害。