阿笠博士帶著少年偵探團(tuán)到深山里挖竹筍的時(shí)候，車子突然出現(xiàn)故障，柯南等人被迫留在深山之中。為了避雨而來(lái)到這里別墅區(qū)的少年偵探團(tuán)被一陣鋼琴聲所吸引，于是，大伙兒進(jìn)入這棟別墅，雖然這里有人生活的痕跡卻沒(méi)有看到半個(gè)人影，而且留在現(xiàn)場(chǎng)的日記還寫著可怕的內(nèi)容，之后大家決定找出日記中出現(xiàn)的被綁架男孩，這時(shí)，屋內(nèi)突然停電，伴隨著少年偵探團(tuán)的恐慌鋼琴聲再次響起。

案件終于有了眉目，就在柯南和大和針對(duì)謎題展開討論時(shí)，高明從昏迷中蘇醒，三人一起計(jì)劃了一出空城計(jì)。他們故意對(duì)三個(gè)嫌疑人放出關(guān)鍵信息，引誘他前去直木司郎家找重要的證據(jù)，果然不所料兇手暗中潛伏在直木司郎家附近，為了讓狡猾的他放松警惕，柯南聯(lián)合小蘭、大和等人上演了一場(chǎng)能證明周遭沒(méi)有警察的犯罪戲碼，引誘兇手自投羅網(wǎng)。

小蘭和小五郎按照指示來(lái)到了車站，就在這時(shí)阿波羅發(fā)現(xiàn)了在車站里奇怪的男人并得到了接下來(lái)的線索U字。之后小蘭一行來(lái)到了接下來(lái)的提示的瓷器店而這時(shí)阿波羅和母親一起離開剩下小五郎和小蘭繼續(xù)尋找線索。第二天在警方的要求下小蘭眾人繼續(xù)破解沒(méi)有完全解開的暗號(hào)，而就在眾人解開暗號(hào)來(lái)到會(huì)場(chǎng)之后，柯南發(fā)現(xiàn)賽場(chǎng)上的米奈芭有些不對(duì)勁！

柯南被小五郎拜托照顧一個(gè)叫圣誕的兩歲孩子，因?yàn)樗膵寢屖幼罱偸潜徊幻魅耸扛櫍谑切∥謇砂抵羞M(jìn)行保護(hù)，沒(méi)想到在茂子幫清潔公司送衣服是時(shí)候被人綁架，為解救人質(zhì)尋找更多的線索，柯南和圣誕來(lái)到他的家里進(jìn)行調(diào)查，在一片狼藉的屋內(nèi)柯南發(fā)現(xiàn)了鳥的羽毛，這一定是從歹徒身上掉下來(lái)的，之后，他和圣誕一起展開了行動(dòng)，最終柯南找到綁架犯，而這一切竟然是一場(chǎng)無(wú)聲的誤會(huì)！

來(lái)到倫敦的柯南不小心以新一的身份向小蘭暴露在倫敦的事實(shí)，而此時(shí)柯南喝下了回國(guó)用的解毒劑暫時(shí)以新一的身份出現(xiàn)！在繼續(xù)調(diào)查的過(guò)程中小蘭從以前新一說(shuō)過(guò)的話中得到啟發(fā)發(fā)現(xiàn)了人偶的秘密。而之后通過(guò)與新一電話中發(fā)現(xiàn)了更多的線索。這時(shí)小蘭和小五郎碰到了米奈芭小姐，在米奈芭和弟弟阿波羅的協(xié)助下小蘭留在教堂的紙片，而上面寫著的就是接下來(lái)的線索。