因接到電視臺的邀請，小五郎便帶著柯南和小蘭飛到?jīng)_繩，參加一個與職棒選手能勢和主持人本山對談的節(jié)目錄制。在機(jī)場與本山會合之后，一行人打算去能勢下榻的酒店接他，沒想到卻在半路發(fā)現(xiàn)了能勢的尸體，期間，本山的一句話讓柯南認(rèn)定他就是兇手，可能勢死亡的時候，他正在飛機(jī)上，因此有充分的不在場證明，那么，他到底是如何往返于兩個地方犯案的？

13年前，發(fā)生過的國友淳大的沉船海難事件和公館全體工作人員的家屬死亡事件漸漸的浮上水面。柯南認(rèn)為有恐高癥的波花不會接近關(guān)口被殺的3層的陽臺，所以很難行兇。同樣茂子，綿引，赤冢也有奇怪的習(xí)慣和病癥，都不太可能是殺害關(guān)口的犯人。而在藥瓶上檢測出來的未知的指紋更使兇手的身份疑團(tuán)加深，但是在柯南的推理下最終確定了兇手的身份。

正影的三弟子之一姬宮遇害后，警方匆忙趕來調(diào)查并對屋內(nèi)所有人一一進(jìn)行偵訊，正影的妻子滿里太太說，被翻亂的資料室內(nèi)有記載正影自創(chuàng)魔術(shù)的筆記本，而且在五年前曾有一個戴著帽子和墨鏡的男人找過正影，于是，大家正影的房間希望能從他的相冊中找到這個可疑男人，柯南和服部也在這里有了新發(fā)現(xiàn)，就在這時，和葉和小蘭回想起了看到尸體時的怪異場景。

柯南他們在一家新開的飯店吃飯時，碰巧遇到了參加聯(lián)誼的高木和佐藤警官，然而，在聯(lián)誼進(jìn)行的同時，參加者江本彩的五歲表弟浩太被人綁架，根據(jù)彩和她弟弟將史的說法，警察將目標(biāo)鎖定在將史的三個朋友之中，可是，經(jīng)過一一調(diào)查卻并沒有發(fā)現(xiàn)有何異樣，難道犯人不在他們之中？

某日清晨，柯南等人正在觀察4只青蟲時看到有警車在附近停靠。為打探消息柯南他們隨即趕往現(xiàn)場。根據(jù)高木刑警的敘述得知，獨自生活的一位老人被殺。利用午休時間，高木等人來到學(xué)校。據(jù)說昨晚，有個少年剛巧目擊了犯罪經(jīng)過警方隨即來尋找那名少年。高木雖然找到了那名目擊者圭一，但是圭一卻不承認(rèn)看到過犯人。