根據(jù)紙飛機(jī)上的圖案，柯南和沖矢幾乎在同一時(shí)間明白這是急救用的摩斯密碼，而投紙飛機(jī)的人想傳達(dá)的則是緊急求救的信息，之后，小蘭將其他兩只紙飛機(jī)發(fā)到新一的手機(jī)上，將這三個(gè)帶有暗號(hào)的紙飛機(jī)串聯(lián)在一起，新一推斷出被綁架的人就是電視上成日?qǐng)?bào)道的代田社長(zhǎng)以及他所在的地點(diǎn)，得知這些以后，小蘭不顧自己的安危沖進(jìn)了綁匪的據(jù)點(diǎn)。

鈴木次郎吉宅邸中的大保險(xiǎn)柜——鐵貍是由幕末的機(jī)關(guān)師三水吉右門(mén)衛(wèi)制造的無(wú)法攻陷的最強(qiáng)保險(xiǎn)柜。針對(duì)鐵貍，怪盜基德拋出了挑戰(zhàn)書(shū)，揚(yáng)言自己將打開(kāi)那個(gè)擊退了無(wú)數(shù)盜賊的堅(jiān)固門(mén)扉，然而在鐵貍外，次郎吉還安裝了與重量傳感器聯(lián)動(dòng)的防盜裝置，任誰(shuí)想要接近保險(xiǎn)柜都極其困難。在預(yù)告作案的當(dāng)天，中森警官率領(lǐng)警隊(duì)進(jìn)行了嚴(yán)密的布防，可是基德的第二封預(yù)告信還是出現(xiàn)在了保險(xiǎn)柜前，難道他已潛入宅邸？

阿笠博士和少年偵探團(tuán)一起去看sprite的球賽，然而在最后關(guān)頭sprite卻輸?shù)袅吮荣悾谑牵恍腥藥е吐涞男那榍巴儇浌荆驗(yàn)殡y以接受事實(shí)而獨(dú)自一人留下，可在踢球的時(shí)候因摔倒而短暫暈厥過(guò)去，待他醒來(lái)?yè)烨虻臅r(shí)，卻發(fā)現(xiàn)了之前在停車(chē)場(chǎng)結(jié)識(shí)的德國(guó)人滿頭是血，讓人疑惑的是他在陷入昏迷之前一直指著元太，所幸柯南破解了他留下來(lái)的訊息并將嫌疑人鎖定在三人之中。

小林老師在圖書(shū)館里發(fā)現(xiàn)了一個(gè)牛皮錢(qián)包，那里放了小學(xué)一年級(jí)時(shí)小蘭留的字條。事情追溯到十年前，為證實(shí)謠言的真假，小蘭和新一夜訪校園，不想?yún)s在學(xué)校圖書(shū)館遇到了一個(gè)自稱(chēng)是新一弟弟的神秘男子，他向新一發(fā)出挑戰(zhàn)并在留下了一個(gè)裝有暗號(hào)的牛皮錢(qián)包后離開(kāi)。于是，新一和小蘭二人就在阿笠博士的幫助下展開(kāi)了解謎暗號(hào)的尋寶之旅！

柯南，小哀，步美等人與阿笠博士一同去了SFMP4電影《星劍戰(zhàn)記Ⅵ》的試映會(huì)。開(kāi)場(chǎng)前，排著隊(duì)的柯南等人結(jié)識(shí)了攝影師建井文吾。原來(lái)，建井是這部電影的忠實(shí)影迷，他和女友亞美就是在這部電影的試映會(huì)上相識(shí)的。而這時(shí)建井卻突然接到電話走開(kāi)，他不自然的行為引起了柯南的注意，最終柯南讓俺們阻止了建井的復(fù)仇行為并解開(kāi)了建井的心結(jié)。