這天作為地區(qū)體驗(yàn)采訪的嘉賓，小蘭和柯南來(lái)到了岡山。在參觀美術(shù)館的時(shí)候遇到失去記憶的奇怪女人，而在經(jīng)過(guò)檢查后發(fā)現(xiàn)身上還有扭打的痕跡。而趕來(lái)小五郎接受了調(diào)查她過(guò)去的委托。通過(guò)她畫(huà)的畫(huà)小蘭她們開(kāi)始尋找她的記憶，而就在這時(shí)柯南發(fā)現(xiàn)她們被跟蹤了。在來(lái)到野崎家的大宅之時(shí)出現(xiàn)了認(rèn)識(shí)她的人而她的名字是吉瀨萬(wàn)由美，找回名字的萬(wàn)由美卻突然逃走了！

這兩人竟然是長(zhǎng)野縣警官上原由衣和大和敢助，他們此次前來(lái)的目的是讓柯南和小五郎幫忙破解沾滿鮮血的赤壁之謎！于是一行人來(lái)到案發(fā)的希望之館，這里曾經(jīng)住著六個(gè)很有才華的年輕人，自從三年前一名女性小葵心臟病發(fā)去世之后，她的丈夫明石周作就獨(dú)自一人留在館內(nèi)生活，可是他卻被人鎖在館內(nèi)的屋中活活餓死，如今能看到的只有他留下的奇特死亡訊息，這時(shí)，大和警官的死對(duì)頭諸伏高明警官也來(lái)到館內(nèi)進(jìn)行調(diào)查。

從昏迷中醒來(lái)的陽(yáng)菜趁父母爭(zhēng)吵之際悄悄溜出醫(yī)院，按照歹徒的指示去拿彩虹之子，而這一切都在柯南的預(yù)計(jì)范圍內(nèi)，他讓服部暗中進(jìn)行追蹤，期間，小蘭用她撿到的步美的徽章聯(lián)系上了少年偵探團(tuán)并暗示她所在的地點(diǎn)，雖然歹徒發(fā)現(xiàn)了服部等人，但柯南還是找到了陽(yáng)菜和歹徒要去的地方，見(jiàn)勢(shì)不妙想要逃跑的歹徒被得到救援的小蘭一招制服，然而，幕后的指使者卻另有其人。

在鈴木財(cái)團(tuán)的支持下龍馬展的保全措施做的非常好，而柯南在廁所思考之前遺失的龍馬遺物的時(shí)候基德忽然出現(xiàn)！柯南追著基德來(lái)到展館內(nèi)部的時(shí)候發(fā)現(xiàn)園子的袖子上粘到了奇怪奇怪的東西，而柯南也發(fā)現(xiàn)了基德所謂下雨的真實(shí)含義。基德按照約定來(lái)到了展館內(nèi)而樽見(jiàn)利用假的被盜信息來(lái)出售贗品的事實(shí)也最終曝光。

小五郎受到一個(gè)名叫立李三可的委托，帶著柯南和小蘭一起來(lái)到群馬縣調(diào)查真相，途中他們遇見(jiàn)了德備六朗和荒巖，并從他們口中得知了11年前有一個(gè)名叫辰彥的孩子在旅館附近的河中溺斃而亡的事件，這與信中所提及的殺人案有何聯(lián)系？辰彥父親同時(shí)也是約見(jiàn)地點(diǎn)光羅旅館的老板沼山伴藏也讓人覺(jué)得很怪異，次日清晨，滿身都是刺鼻氣味液體的伴藏死在了旅館的頂樓房間，難道是小蘭昨晚在河邊看到的河童下的毒手嗎？