放課后，小林老師神神秘秘的讓同學(xué)們都離開教室，待大家午餐完畢返回教室，卻發(fā)現(xiàn)黑板上留有一張“怪人二百面相”的字條，柯南一眼就看穿了這個(gè)江戶川亂步迷老師的意圖，之后，同學(xué)們又紛紛從自己的抽屜里找到了數(shù)字和篩子的圖紙，柯南輕松看出暗號(hào)的所指，就在他要揭秘時(shí)卻被廣播叫走，解謎的重任就交給了1年B班所有同學(xué)，沒有柯南的幫助，他們能否解開暗號(hào)找到老師呢？

柯南他們很快就找到了被害者們常去的麻將館，并從老板那里得知，曾有一個(gè)叫鬼保獨(dú)郎的人與平棟堂次發(fā)生過沖突，抓到嫌疑犯后，高木警官便前去找曾聽到兇手聲音的鍋井永貴做指認(rèn)，沒想剛進(jìn)門就被人打昏。另一邊，柯南因?yàn)椴矫酪痪渫嫘υ挘蝗幌胪薢的含義并說兇案早在十五年前就結(jié)束了，此次兇案的發(fā)生不過是模仿犯所為而兇手就在被害者的家屬之中。

在屋內(nèi)調(diào)查的過程中，柯南發(fā)現(xiàn)了多處疑點(diǎn)，干凈的浴室、沒有插電的刮胡刀、消失的牙刷以及洗衣機(jī)內(nèi)的衣服，就在他苦思冥想到底誰是兇手時(shí)，園子無意中的一句話提醒了他，原來榔頭男從一開始就不存在，這不過是都市傳而已，就在目暮警官等人一頭霧水時(shí)，柯南將園子麻醉，利用變聲領(lǐng)結(jié)道出了真相。

小五郎一行人駕車來到杯戶中央橋卻并沒有任何發(fā)現(xiàn)，這時(shí)，園子突然打來電話，小蘭從園子那里得知了板垣樂隊(duì)的標(biāo)志正是釘子，于是一行人又來到了附近的紋身店，并從顧客所留的照片中將嫌疑鎖定在三個(gè)身上，如今有關(guān)鋸子和釘子的線索都得到了解釋，那目擊者所看到的錘子又是什么呢？注意到對(duì)面的大樓后，柯南知道所謂的錘子，在他的提示下小五郎找到了兇手。回家路上，柯南洞察到了本堂瑛佑的意圖，他到底是什么人？

小五郎應(yīng)邀去一個(gè)劇團(tuán)監(jiān)控現(xiàn)場(chǎng)狀況，查看中柯南誤入道具室，沒想到他竟然在那里聽到了演員駒塚的殺人計(jì)劃，而且自己還十分不幸的被駒塚發(fā)現(xiàn)并監(jiān)禁了起來，計(jì)劃逃跑的這段時(shí)間內(nèi)，演員伴野和矢吹陸續(xù)來到這里在道具上做手腳，得知了三個(gè)心懷鬼胎的人所制定的殺人計(jì)劃后，柯南能否在戲劇開始前阻止他們的殺人行動(dòng)？