妖怪倉庫是把貴重的物品放進里面就會立刻消失的倉庫，少年偵探團為了弄清真相決定一探究竟，元太他們?yōu)榱俗尶履下冻鰺o話可說的表情而干勁滿滿。在調(diào)查了倉庫內(nèi)部之后，柯南只看到了地板上留下的零星腳印和嵌在墻上的大算盤，除此之外別無他物。但從外面的天窗向里面看的話，就能看到堆積如山的寶物，可意外的是當再次打開倉庫的門時，里面的寶物就全都消失不見，柯南提出的天花板和地板機關(guān)的猜想被光彥等人否認，難道妖怪倉庫真的存在？

來到野營地拍攝宣傳片的話題演員宮坂被殺害，而兇手就在野營地之中。而與宮本有正面沖突的山本，沖田和冴子嫌疑重大。就在柯南去勘察犯罪現(xiàn)場之時，美妃看到鷹山從窗邊逃走，就在眾人追尋鷹人來到懸崖之時發(fā)現(xiàn)鷹人已經(jīng)墜崖身亡！而就在看了沖田的錄像后柯南發(fā)現(xiàn)了兇手的犯罪手法，犯人最終也承認了自己的罪行。

柯南從一開始知道兇手是誰，為了證實自己的想法他又進行了確認，沒錯，這個人就是浦井星江！雖然知道了兇手的真面目但是她到底使用了什么手法，因為案發(fā)時她正在為小蘭看手相，根本沒機會在浦井社長杯子里下毒，就在他專心思考案情時，千葉和佐藤的談話給了他啟發(fā)，同時小五郎亂丟的煙頭也指向了關(guān)鍵的線索，于是，他麻醉小五郎說出真相。案件結(jié)束后，落寞的小蘭看著別人的甜蜜不禁流下眼淚，今年的白色情人節(jié)能收到新一的回禮嗎？

柯南被小五郎拜托照顧一個叫圣誕的兩歲孩子，因為他的媽媽石川茂子最近總是被不明人士跟蹤，于是小五郎暗中進行保護，沒想到在茂子幫清潔公司送衣服是時候被人綁架，為解救人質(zhì)尋找更多的線索，柯南和圣誕來到他的家里進行調(diào)查，在一片狼藉的屋內(nèi)柯南發(fā)現(xiàn)了鳥的羽毛，這一定是從歹徒身上掉下來的，之后，他和圣誕一起展開了行動，最終柯南找到綁架犯，而這一切竟然是一場無聲的誤會！

殺人案件發(fā)生之后，警方立刻調(diào)查旅館中所有人的不在場證明，與此同時，小五郎等人分別進入德備、荒巖以及野平的房間，查看他們是否有能夠運送液體的容器，期間，身為畫家的德備提議把小蘭所看的到的河童畫下來，就在大伙聚在德備房內(nèi)研究河童時，柯南發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵線索，他將大談外星人理論的山村警官麻醉，說出了事情的真相，至于小蘭看到的河童，那不過是……