小五郎受到一出推理劇的邀請(qǐng)負(fù)責(zé)前言部分的講解，巧合的是他在這里與他的國(guó)中同學(xué)，當(dāng)前的大明星雨城瑠璃再度重逢。片場(chǎng)的偵探演員風(fēng)見(jiàn)良輝，總是惡語(yǔ)傷人，把每一個(gè)人都搞的很不愉快，于是，導(dǎo)演建議大家先休息三十分鐘，此時(shí)正好下起了大雪，瑠璃邀請(qǐng)大家外出賞雪，可是沒(méi)過(guò)一會(huì)兒，別墅內(nèi)傳出了瑠璃驚恐的尖叫，柯南等人急忙趕去，看到的卻是倒在血泊里的風(fēng)見(jiàn)，警方趕來(lái)后對(duì)波原霞、南云曉、南云伸晴和雨城瑠璃這四名最有嫌疑的人進(jìn)行了搜查，然而卻并未發(fā)現(xiàn)兇器。

小蘭在英語(yǔ)課上開(kāi)小差后被老師朱蒂發(fā)現(xiàn)，看到了『×』的標(biāo)記，但卻不知其意。放學(xué)后，園子同朱蒂與柯南一起去咖啡店。突然大廈內(nèi)停電，咖啡店邊的電梯發(fā)現(xiàn)男性的尸體。是誰(shuí)被殺了，而在死者隨身帶著的資料帶上有用血書(shū)寫(xiě)的『○×△』又有什么意思？是被害者留下的暗示嗎，柯南發(fā)現(xiàn)死亡信息的不同之處，是否解開(kāi)了死亡信息的謎題？

高木警官和佐藤警官瞞著警局里的同事們，偷偷在熱帶樂(lè)園的水世界見(jiàn)面，為了阻撓他們的約會(huì)，警局的同事們暗中搗鬼，安排柯南，光彥等人出現(xiàn)在他們面前，就在這個(gè)時(shí)候，高木警官原本裝有求婚戒指的包居然出現(xiàn)毒品，之后，他意識(shí)到這一定是在搭乘“海地五萬(wàn)里列車”時(shí)被人調(diào)了包，柯南根據(jù)這個(gè)包包的肩帶判斷出他的主人是個(gè)左撇子，并根據(jù)當(dāng)時(shí)所拍攝的照片和游客所填寫(xiě)的信息表，將目標(biāo)鎖定在一個(gè)叫高城登的人身上。

柯南和阿笠博士從板倉(cāng)的日記磁片中果然找到了他與黑暗組織接觸過(guò)的線索，這讓柯南興奮不已，于是兩人立馬趕往板倉(cāng)的別墅，企圖找到板倉(cāng)所開(kāi)發(fā)的系統(tǒng)軟體和黑衣組織發(fā)來(lái)的郵件，然而，讓他們沒(méi)想到的是，郵件竟然有密碼，如果在一定時(shí)間內(nèi)沒(méi)有打開(kāi)，郵件將自動(dòng)刪除，而這將引起黑衣組織的懷疑，這時(shí)，屋內(nèi)的電話響起，從另一邊傳來(lái)沃克質(zhì)疑的聲音，柯南和阿笠博士該如何應(yīng)對(duì)？

電視臺(tái)為了舉辦一場(chǎng)東西推理大對(duì)決，便邀請(qǐng)小五郎和服部一起來(lái)沖繩島。之后大家與電視臺(tái)的工作人員事先搭船到發(fā)現(xiàn)不明男尸與詭異文字的無(wú)人島，考察完畢準(zhǔn)備返回時(shí)，卻在海灘上發(fā)現(xiàn)了被不明人士殺害的工作人員之一平良小姐，而在她的身旁還留下了一行讓人不快的字句，就在服部和柯南進(jìn)行推理時(shí)，送他們來(lái)的船只和船長(zhǎng)也消失了蹤影。