為了陪光彥把壓歲錢存進(jìn)賬戶，柯南、步美和灰原等人一起來(lái)到帝都銀行，可元太因?yàn)槌蕴辔竿戳似饋?lái)，就在博士和灰原外出買藥期間，一波帶著面具的搶匪突然闖進(jìn)銀行，前來(lái)取錢的茱蒂老師以及一名貌似赤井秀一的人也成為了他們的人質(zhì)，雖然茱蒂用美人計(jì)在廁所獨(dú)立擊倒一名搶匪，卻不幸被同伙發(fā)現(xiàn)，事已至此，少年偵探團(tuán)成為了將徒制服的唯一希望！

柯南并沒(méi)有從步美找到的照片中發(fā)現(xiàn)重要的線索，便將破案的關(guān)鍵再次鎖定日記，仔細(xì)反復(fù)查看之后，柯南發(fā)現(xiàn)了其中的端倪，于是，他再次來(lái)到琴房確認(rèn)自己的發(fā)現(xiàn)，沒(méi)想到步美等人放在門口的背包不翼而飛，而且大家還注意到了鋼琴旁邊凳子的變化，一切如柯南所料，他讓步美、元太和光彥等人高唱?dú)g快的歌曲，果然將躲在黑暗中悄悄觀察他們的人揪了出來(lái)。

小五郎受邀來(lái)到Nijimura品牌店，卻正好目擊社長(zhǎng)仁地村被人綁架的畫面。社長(zhǎng)的妻子兼副社長(zhǎng)沙希，按照綁架犯的要求帶著一億贖金搭電車解救人質(zhì)，就在電車開往中戶呂鐵橋的時(shí)候，沙希按照指示將包包從窗戶丟到河里，而此刻正趕上泄洪，包包隨著增加的河水被沖走，待警方在五公里外的河岸發(fā)現(xiàn)時(shí)，贖金已經(jīng)被犯人拿走，而社長(zhǎng)仁地村也被殺害。雖然事情已經(jīng)結(jié)束，但柯南和小五郎卻重返現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行調(diào)查，并發(fā)現(xiàn)……

就在步美、元太他們因?yàn)槊魈炜床坏狡诖那騿T上場(chǎng)而唉聲嘆氣時(shí)，結(jié)識(shí)了一個(gè)名叫代田恭三的男人，他將對(duì)明天無(wú)限憧憬的正能量傳達(dá)給了少年偵探團(tuán)，大家也因此變的積極起來(lái)，但柯南卻察覺(jué)到這個(gè)人的異常，果不其然這個(gè)看似充滿希望的人卻企圖臥軌自殺，這到底是為了什么？小蘭誤接了“紅色長(zhǎng)袖t恤之謎”的委托，于是，柯南和小五郎一起去百貨公司會(huì)見(jiàn)委托人，不想?yún)s在這里遇到……

小蘭和小五郎按照指示來(lái)到了車站，就在這時(shí)阿波羅發(fā)現(xiàn)了在車站里奇怪的男人并得到了接下來(lái)的線索U字。之后小蘭一行來(lái)到了接下來(lái)的提示的瓷器店而這時(shí)阿波羅和母親一起離開剩下小五郎和小蘭繼續(xù)尋找線索。第二天在警方的要求下小蘭眾人繼續(xù)破解沒(méi)有完全解開的暗號(hào)，而就在眾人解開暗號(hào)來(lái)到會(huì)場(chǎng)之后，柯南發(fā)現(xiàn)賽場(chǎng)上的米奈芭有些不對(duì)勁！