小五郎帶著小蘭、柯南應(yīng)邀去參加精通葡萄酒的日下的宴會(huì)，那里還邀請(qǐng)了眾多葡萄酒愛(ài)好者。但是去酒窖里取珍藏已久的葡萄酒的日下卻始終沒(méi)有回來(lái)。小五郎和日向夫人前往酒窖看看狀況時(shí)才發(fā)現(xiàn)日向已經(jīng)被殺害。柯南無(wú)意發(fā)現(xiàn)了地上的刻意痕跡推理出兇手的犯罪手法。另一方面警官調(diào)查后門確認(rèn)無(wú)法盜用鑰匙進(jìn)入。而在高木警官的親身試驗(yàn)后“沉睡的小五郎”道出了兇手的犯罪手法并指出了手絹上酒漬的證據(jù)。

某天突然神秘女子池波來(lái)到事務(wù)所說(shuō)要尋找中學(xué)同學(xué)柴田。通過(guò)池波提供的照片小五郎很快就找到了柴田，他們一行人立刻去了柴田家。就在進(jìn)入池田家的時(shí)候卻發(fā)現(xiàn)池田已經(jīng)被殺害而死時(shí)手里捏著的正式池波年輕時(shí)的照片！而柯南對(duì)這位委托人不夠完美的說(shuō)詞充滿了疑問(wèn)。在不斷的調(diào)查中柯南發(fā)現(xiàn)神秘女子的疑團(tuán)不斷增多，池波究竟是何方神圣？

柯南在調(diào)查橘律師釣魚(yú)的小船之后發(fā)現(xiàn)可疑的痕跡和莫名遺失的船錨。之后衫村小姐說(shuō)出熊田達(dá)也事情的真相。在看到約翰的狗屋的牌子之后柯南發(fā)現(xiàn)了兇手的身份。利用小五郎的沉睡，柯南向眾人闡述了兇手利用潮水漲落的犯罪手法和殺害熊田達(dá)也的發(fā)法。而兇手也主動(dòng)承認(rèn)了罪行并道出了殺人的理由。

打算盜取鈴木財(cái)閥家的黑珍珠BLACK STAR的怪盜基德，想起了以前關(guān)于鐘臺(tái)的一個(gè)事件，那是工藤新一和怪盜基德的第一次交手。另一方面，小五郎的事務(wù)所里收到一封附有支票的不明發(fā)信人的信函，并且在其上方還有一行奇怪的話語(yǔ)。

被害的真紀(jì)的因?yàn)殄X包不見(jiàn)了，被疑為是強(qiáng)盜殺人。乍看之下雖然像是強(qiáng)盜殺人，柯南卻肯定兇手是這些大學(xué)生一行人中的某人。雖然懷疑藤浩的不在場(chǎng)證明是否可以確立，這時(shí)這一行人中復(fù)雜的人際關(guān)系一點(diǎn)一點(diǎn)浮現(xiàn)出來(lái)。這次的殺人事件中，隱藏著另外一個(gè)邪惡的計(jì)劃。在“沉睡的小五郎”的解說(shuō)下兇手最終浮出水面來(lái)。