園子和小蘭被邀請(qǐng)去皆川家參加情人節(jié)派對(duì)，柯南悄悄尾隨卻被發(fā)現(xiàn)。皆川的母親熱情招待各位，但皆川卻是一副不耐煩的樣子，他拒絕了青梅竹馬關(guān)谷香的巧克力，又對(duì)直道和若松冷嘲熱諷，狀態(tài)不佳的他決定外出透氣，他的心儀對(duì)象好美也一起跟去，突然一聲尖叫，皆川倒在了草坪上，到底是誰(shuí)在情人節(jié)制造了慘劇？

少年偵探團(tuán)，在機(jī)緣巧合下和最受歡迎組合TWO-MIX的主唱高山美奈美一起吃飯，高山為找搭檔永野椎菜，一人跑出了演唱會(huì)的會(huì)場(chǎng)。后來(lái)在餐廳外，歹徒當(dāng)著柯南的面將高山推入車(chē)中綁架，他們要求少年偵探團(tuán)拿著TWO-MIX最新的歌曲練習(xí)帶去交換人質(zhì)，歹徒在電話(huà)里讓少年偵探團(tuán)把警察甩掉并讓步美一人前去，于是柯南和步美調(diào)換身份。

某日，一個(gè)自稱(chēng)柯南媽媽的陌生女人來(lái)接他，柯南第一反應(yīng)就是她可能是黑衣組織的人，因?yàn)樗宄履霞业牡准?xì)以及他的真實(shí)身份，期間，柯南雖趁機(jī)逃脫，但去找阿笠博士的時(shí)再次候被抓，他聽(tīng)到了那個(gè)女人和一個(gè)面具男討論交易藥物的事情，待他們離開(kāi)后柯南按照那伙人留下了線(xiàn)索找到交易地點(diǎn)，可不幸的是他行跡暴露，面具人對(duì)他槍口相向……

當(dāng)晚發(fā)生殺人案件的書(shū)房是完全的密室，而屋外的雪地上也沒(méi)有腳印。犯人是怎樣到書(shū)房的呢？在大家都將兇嫌箭頭指向搞外遇的妻子和情夫時(shí)，柯南卻看出破綻。一樁多年前的恩怨所埋下了憤恨的殺機(jī)的事實(shí)漸漸浮出了水面。最終柯南發(fā)現(xiàn)了兇手的犯罪手法并將其公之于眾，而兇手也最終承認(rèn)了因?yàn)槊妹玫娜ナ蓝饸⒛畹氖聦?shí)。

身體變小后柯南轉(zhuǎn)入帝丹小學(xué)，并結(jié)識(shí)了步美、光彥和元太。某日，明星洋子來(lái)到毛利偵探事務(wù)所，說(shuō)總感覺(jué)有人暗中監(jiān)視她，為了更進(jìn)一步了解真相，毛利一行人來(lái)到洋子住處，可開(kāi)門(mén)后居然有具死尸橫在門(mén)口，期間柯南發(fā)現(xiàn)了另一名演員優(yōu)子的耳環(huán)并且還注意到洋子的經(jīng)紀(jì)人山岸神態(tài)怪異，洋子、山岸、優(yōu)子到底誰(shuí)才是真正的兇手。