受宿里村村長之邀，柯南和平次等人共同前往宿里村尋寶。到達旅店后，通過與其他幾位考古學家和歷史學家交談，他們得知在寶藏的埋藏之處曾發生過塌方事故，其中一位外國挖掘隊員在彌留之際寫下了意為“鵺”的字條，而鵺正是傳說中極為兇猛的怪獸。飯后當眾人準備回房休息，平次卻突然發現門前失火，眾人在火中看到了體型巨大的怪獸。為了一探究竟的柯南和平次在追蹤怪獸的過程中，卻發現了倒在血泊中已經喪命的歷史學家。

根據友寄夫人的回憶，寫有打開機關盒方法的紙條被丈夫藏在了某本書中，眾人紛紛開始查閱圖書館中的藏書?？履显诨貞浻鸭姆蛉怂灾?，頓悟了紙條被藏匿的方法，并推理出紙條所在的書籍。正當眾人齊心協力想要從書中找出紙條時，圖書館突然停電陷入一片黑暗，柯南等人趕緊前往放置機關盒的展廳，卻發現基德早已留下卡片逃之夭夭。

警方分別對三位女當事人進行了詢問，并檢查了她們隨身攜帶的物品，而案發現場所發現的白色涼鞋成為了本案最大的疑點。在諸多線索的指引下，柯南和世良很快便推理出兇手的身份，但卻未能明白兇手的作案手段。最終在園子不經意的提示下，柯南順利地將案發過程演繹給眾人，成功找出真兇。而兇手與死者之間，竟有這樣一段不為人知的往事……

早上，米小圈父親和媽媽商量老家一個親戚二叔病了，他身邊無兒無女生活非常不方便，媽媽同情地說可以接來照顧幾天，媽媽這句話正中爸爸下懷，他立刻去收拾雜物室，看到爸爸這么積極，媽媽知道又上當了。姜小牙給米小圈看自己新得到的自行車，米小圈羨慕得不行，姜小牙說這輛自行車是他爺爺送的，另一個同學鐵頭也說他爺爺為他買了一個大榴蓮，可好吃了，米小圈又羨慕得不行，什么時候他爺爺也能送這么多禮物??！終于下午回到家，米小圈看到二大爺回來了，他興奮地將二爺爺接到自己臥室住，看著兒子如此善解人意，米小圈的父親非常高興，覺得孩子終于能夠尊老愛幼了，母親不以為然，她覺得米小圈心里一定又在打什么壞主意。果真晚上，米小圈給爺爺錘完腿后，故意指著電視上的兒童自行車，問爺爺知不知道他缺什么，爺爺點點頭，第二天，爺爺在學校附近無意中看到孫子羨慕地摸著別的同學的自行車，被同學無情嘲笑，他拉著孫子說回來爺爺也給你買一輛。爺爺的話讓米小圈無比高興，激動地一下午耳朵都嗡嗡直響，到了晚上，天色很晚了，米小圈一臉憧憬地來到樓下等著看爺爺給他買的自行車，等了好久，等到花都謝了，終于看到了爺爺的影子，米小圈興奮地跑上前問爺爺新自行車在哪里？

17年前日本將棋四冠王羽田浩司遇襲案讓柯南非常在意，和他同日遇害的還有同一酒店的美國資本家阿曼達，柯南和灰原推測這是組織所為，但羽田浩司遇害時的房間卻不像是組織的一貫風格。地產公司社長被害時手里拿著阿笠博士發明的剪刀，目暮警官請阿笠博士來說明剪刀的用途看是否能為破案提供幫助，柯南注意到這次的案件卻與17年前羽田浩司遇害案非常相似。